如何使 MRI 图像居中

Question

我从事核磁共振检查。问题是图像并不总是居中。此外，患者身体周围常有黑色条带。

我希望能够像这样移除黑色边框并将患者的身体居中：

我已经尝试通过读取像素表来确定患者身体的边缘，但我还没有得出任何非常确凿的结论。

事实上，我的解决方案仅适用于 50% 的图像...我没有看到任何其他方法...

开发环境：Python3.7 + OpenCV3.4

Answer 1

我不确定这是执行此操作的标准或最有效的方法，但它似乎有效：

# Load image as grayscale (since it's b&w to start with)
im = cv2.imread('im.jpg', cv2.IMREAD_GRAYSCALE)

# Threshold it. I tried a few pixel values, and got something reasonable at min = 5
_,thresh = cv2.threshold(im,5,255,cv2.THRESH_BINARY)

# Find contours:
im2, contours, hierarchy = cv2.findContours(thresh,cv2.RETR_TREE,cv2.CHAIN_APPROX_SIMPLE)

# Put all contours together and reshape to (_,2).
# The first "column" will be your x values of your contours, and second will be y values
c = np.vstack(contours).reshape(-1,2)

# Extract the most left, most right, uppermost and lowermost point
xmin = np.min(c[:,0])
ymin = np.min(c[:,1])
xmax = np.max(c[:,0])
ymax = np.max(c[:,1])

# Use those as a guide of where to crop your image
crop = im[ymin:ymax, xmin:xmax]

cv2.imwrite('cropped.jpg', crop)

你最终得到的是这样的：

Answer 2

有多种方法可以做到这一点，这就是计算机视觉提示和技巧的答案。

如果质量在中心，而外面的区域总是黑色的，你可以threshold 图像，然后像你一样找到边缘像素。我会在边框上添加 10 个像素以调整阈值过程中的差异。

或者，如果正文的大小始终相似，you can find the centroid of the blob (white area in the threshold image), and then crop a fixed area around it。