获取 hextop 自组织映射神经元连接答案

【问题标题】：Get hextop self-organizing map neuron connections获取 hextop 自组织映射神经元连接
【发布时间】：2016-02-06 08:23:53
【问题描述】：

如何获得一个包含 SOM 中神经元连接的 n×2 向量？例如，如果我有一个简单的 2x2 hextop SOM，则连接向量应如下所示：

[ 1 2 1 3 1 4 ]

这个向量表示神经元 1 连接到神经元 2，神经元 1 连接到神经元 3，等等。

如何从任何给定的 SOM 中检索此连接向量？

【问题讨论】：

我对@987654321@ 不是很熟悉，我假设你正在使用它，但是看看plotsomnc 的代码，sparse(tril(net.layers{1}.distances <= 1.001)-eye(net.layers{1}.size)) 会给你想要的吗？否则，如果您提供了一个关于如何设置 SOM 网络的基本可运行示例，将会对我们有所帮助。

标签： matlab neural-network self-organizing-maps

【解决方案1】：

假设 SOM 是用邻域距离 1 定义的（即，对于每个神经元，边缘到欧几里得距离 1 内的所有神经元），Matlabs hextop(...) 命令的默认选项，您可以按如下方式创建连接向量：

pos = hextop(2,2);

% Find neurons within a Euclidean distance of 1, for each neuron.

% option A: count edges only once
distMat = triu(dist(pos));
[I, J] = find(distMat > 0 & distMat <= 1);
connectionsVectorA = [I J]

% option B: count edges in both directions
distMat = dist(pos);
[I, J] = find(distMat > 0 & distMat <= 1);
connectionsVectorB = sortrows([I J])

% verify graphically
plotsom(pos)

上面的输出如下：

connectionsVectorA =

     1     2
     1     3
     2     3
     2     4
     3     4


connectionsVectorB =

     1     2
     1     3
     2     1
     2     3
     2     4
     3     1
     3     2
     3     4
     4     2
     4     3

如果您的 SOM 具有非默认邻域距离 (!= 1)，例如 nDist，只需将上面的 find(..) 命令替换为

... find(distMat > 0 & distMat <= nDist);

【讨论】：

@BrianGoodwin 很高兴为您提供帮助。