Cytoscape：避免重叠的分组节点答案

【问题标题】：Cytoscape: Avoid overlapping grouping nodesCytoscape：避免重叠的分组节点
【发布时间】：2018-04-24 13:07:51
【问题描述】：

是否有避免分组节点相互重叠的布局或选项？我得到一个带有独立和分组节点的图表，但组合取决于动态数据。所以我不能把它们放在我的上面，或者想避免它。我尝试过的所有布局都不关心分组节点并将它们的子节点放在一起。例如，'circle' 创建一个由所有节点组成的圆，而不是每组一个圆。

我们的目标是创建类似“http://js.cytoscape.org/demos/5b192c88616af2f75344/”的东西，但节点是手动放置的..

我看到了示例“http://js.cytoscape.org/demos/59e38e9f20e25a293e44/”，它似乎可以按要求工作，但它使用的是扩展名。首先，我想找到一个内置的解决方案。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

您对非扩展解决方案的要求是错误的。

Cytoscape.js 本身只包含基本的、小 KB 布局，布局是否默认包含在功能上没有区别：They are both extensions -- 有些默认包含，有些不包含。

CoSE Bilkent 是图形/网络的最佳复合节点布局算法——没有之一。您也可以使用默认包含的 CoSE。 CoSE 是算法的更基本版本，在某些情况下以牺牲视觉结果为代价对速度进行了优化。

【讨论】：

是的，文档也描述了这一点。但是，对我来说，是有区别的。如果一个框架具有扩展的可能性，并且提供了一些“内置”扩展，那么这个扩展将与框架一起更新和维护。对于第 3 方扩展，它们更可能不是。这就是为什么我想避免他们......如果可能的话！
许多扩展，包括 CoSE Bilkent 都是第一方的。它属于 Github 上的同一个 Cytoscape Consortium 组。第三方扩展不在此组下。