如何将 WEKA 预处理步骤加载到 R 中？

Question

我已使用 WEKA GUI Java here 对数据进行预处理。我现在想在 R 中使用相同的预处理步骤。

比如我想把WEKA GUI的MultiFilter的预处理加载到R中，在RWeka中找不到。

如何将 WEKA 预处理步骤加载到 R 中？

Answer 1

您可以使用 RWeka 或使用比 RWeka 中的可用功能更广泛的 Weka 命令行工具部分加载 WEKA GUI 步骤。因此，您可以通过 R 中的系统命令使用命令行命令扩展 RWeka。幸运的是，WEKA GUI 和 WEKA 命令行中的参数是相同的。我建议提取 weka-src.jar 和 jar xf weka-src.jar 来阅读源代码。

MultiFilter 有很多功能

java weka.filters.MultiFilter --help
java weka.filters.unsupervised.attribute.PartitionedMultiFilter --help

第二个允许您指定属性范围。否则，它们似乎是相同的。

然后你可以运行你的第一个离散化过滤器

java weka.filters.unsupervised.attribute.Discretize -F -B 20 -M -1.0 -R 27 -i yourFile.arff

然后将其输出定向到下一个 Discretize，最终定向到 NumericTransform 和 Resample。命令行通过以下方式提供了有关命令的精彩说明

java weka.filters.unsupervised.attribute.NumericTransform --help
java weka.filters.unsupervised.attribute.Remove --help
java weka.filters.unsupervised.instance.Resample --help
java weka.filters.supervised.instance.Resample --help

您可以从目录结构或索引中查看它们。

RWeka

RWeka 包提供的功能

• 离散化()
• 标准化()
• make_Weka_filter() 为 Weka 过滤器创建 R 接口

并且没有 NumericTransform 和 Remove 函数。您需要使用他们的参数，而不是直接从 WEKA GUI 复制粘贴 java 代码。也许，一种解决方案是使用系统命令并使用它执行 Java 代码，而无需学习 RWeka 本身。 WEKA GUI 和 R 包之间似乎存在一些差距。

在命令行上运行 Weka

即使通过 RWeka 界面缺少命令，您也可以使用 R 中的系统命令。例如，您可以运行删除命令

java weka.filters.unsupervised.attribute.Remove -i yourfile.arff

这样

system("java weka.filters.unsupervised.attribute.Remove -i yourfile.arff")

我有以下设置here，所以我们可以通过以下方式运行 Discretize。

$ cat $WEKAINSTALL/data/iris.arff |tail
6.8,3.2,5.9,2.3,Iris-virginica
6.7,3.3,5.7,2.5,Iris-virginica
6.7,3.0,5.2,2.3,Iris-virginica
6.3,2.5,5.0,1.9,Iris-virginica
6.5,3.0,5.2,2.0,Iris-virginica
6.2,3.4,5.4,2.3,Iris-virginica
5.9,3.0,5.1,1.8,Iris-virginica
%
%
%
$ java weka.filters.unsupervised.attribute.Discretize -i $WEKAINSTALL/data/iris.arff |tail
'\'(6.46-6.82]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(5.13-5.72]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(6.82-7.18]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(4.54-5.13]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(5.74-6.1]\'','\'(2.48-2.72]\'','\'(4.54-5.13]\'','\'(1.78-2.02]\'',Iris-virginica
'\'(6.46-6.82]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(5.72-6.31]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(6.46-6.82]\'','\'(3.2-3.44]\'','\'(5.13-5.72]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(6.46-6.82]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(5.13-5.72]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(6.1-6.46]\'','\'(2.48-2.72]\'','\'(4.54-5.13]\'','\'(1.78-2.02]\'',Iris-virginica
'\'(6.46-6.82]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(5.13-5.72]\'','\'(1.78-2.02]\'',Iris-virginica
'\'(6.1-6.46]\'','\'(3.2-3.44]\'','\'(5.13-5.72]\'','\'(2.26-inf)\'',Iris-virginica
'\'(5.74-6.1]\'','\'(2.96-3.2]\'','\'(4.54-5.13]\'','\'(1.78-2.02]\'',Iris-virginica
$ 

一些有用的信息

1. Use Weka in your Java code

2. 下载 Linux Developer 版本，解压缩并阅读自述文件，其中包含许多关于使用 WEKA 的精彩示例，尤其是在命令行中。

3. 维基here

4. 也许不相关：Generating source code from WEKA classes