【问题标题】:Cartopy pcolormesh with re-normalized colorbar带有重新标准化颜色条的 Cartopy pcolormesh
【发布时间】:2017-05-16 02:06:45
【问题描述】:

我正在尝试绘制全球气溶胶光学深度 (AOD),该值通常在 0.2 左右,但在某些地区可以达到 1.2 或更高。理想情况下,我想绘制这些高值,而不会丢失较小值的细节。对数刻度颜色条也不是很合适,所以我尝试使用docs 中描述的两个线性范围:

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.colors as colors
import numpy as np
import cartopy.crs as ccrs


class MidpointNormalize(colors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        colors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        # I'm ignoring masked values and all kinds of edge cases to make a
        # simple example...
        x, y = [self.vmin, self.midpoint, self.vmax], [0, 0.5, 1]
        res = np.ma.masked_array(np.interp(value, x, y))
        return res

但是,当我尝试使用 Cartopy 绘制 pcolormesh 绘图时,这会中断。根据画廊示例之一创建虚拟数据:

def sample_data(shape=(73, 145)):
    """Returns ``lons``, ``lats`` and ``data`` of some fake data."""
    nlats, nlons = shape
    lats = np.linspace(-np.pi / 2, np.pi / 2, nlats)
    lons = np.linspace(0, 2 * np.pi, nlons)
    lons, lats = np.meshgrid(lons, lats)
    wave = 0.75 * (np.sin(2 * lats) ** 8) * np.cos(4 * lons)
    mean = 0.5 * np.cos(2 * lats) * ((np.sin(2 * lats)) ** 2 + 2)

    lats = np.rad2deg(lats)
    lons = np.rad2deg(lons)
    data = wave + mean

    return lons, lats, data


ax = plt.axes(projection=ccrs.Mollweide())
lons, lats, data = sample_data()
ax.contourf(lons, lats, data,
            transform=ccrs.PlateCarree(),
            cmap='spectral', norm=MidpointNormalize(midpoint=0.8))
ax.coastlines()
ax.set_global()
plt.show()

给我这个,看起来不错:

但是,当使用 pcolormesh 等效项似乎不起作用时,它具有一组 0 到 180 度经度之间的模糊值(图的右半部分),而不是等值线图中看到的波浪图案:

ax.pcolormesh(lons, lats, data, 
            transform=ccrs.PlateCarree(),
            cmap='spectral', norm=MidpointNormalize(midpoint=0.8))

我怎样才能使 pcolormesh 工作?当我对 Cartopy 投影/转换做错了什么时,我通常会看到这一点,所以大概这与 Cartopy 环绕日期线的方式或简单的 matplotlib 示例忽略的边缘情况之一有关,但我想不通出来吧。

请注意,这只发生在使用自定义 Normalization 实例时;没有它,pcolormesh 也会按预期工作。

【问题讨论】:

  • @ImportanceOfBeingErnest pcolormesh 示例(第二个图)具有一组介于 0 和 180 度经度之间的模糊值,而不是等值线图中看到的波浪形图案。当我对 Cartopy 投影/转换做错了事时,我通常会看到这种情况......
  • 好的,谢谢。我已经编辑了这个问题,试图让它更清楚。 0-180度经度是图的右半部分,它应该与左半部分对称(如等高线图)。
  • 是的,只有在使用 MidpointNormalize 来规范色标时。是的,应该是……!

标签: python matplotlib cartopy


【解决方案1】:

这似乎与规范化类中的掩码有关。 所以这是一个有效的版本:

class MidpointNormalize(colors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        colors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        result, is_scalar = self.process_value(value)
        (vmin,), _ = self.process_value(self.vmin)
        (vmax,), _ = self.process_value(self.vmax)
        resdat = np.asarray(result.data)
        result = np.ma.array(resdat, mask=result.mask, copy=False)
        x, y = [self.vmin, self.midpoint, self.vmax], [0, 0.5, 1]
        res = np.interp(result, x, y)
        result = np.ma.array(res, mask=result.mask, copy=False)
        if is_scalar:
            result = result[0]
        return result

完整代码:

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.colors as colors
import numpy as np
import cartopy.crs as ccrs

class MidpointNormalize(colors.Normalize):
    def __init__(self, vmin=None, vmax=None, midpoint=None, clip=False):
        self.midpoint = midpoint
        colors.Normalize.__init__(self, vmin, vmax, clip)

    def __call__(self, value, clip=None):
        result, is_scalar = self.process_value(value)
        (vmin,), _ = self.process_value(self.vmin)
        (vmax,), _ = self.process_value(self.vmax)
        resdat = np.asarray(result.data)
        result = np.ma.array(resdat, mask=result.mask, copy=False)
        x, y = [self.vmin, self.midpoint, self.vmax], [0, 0.5, 1]
        res = np.interp(result, x, y)
        result = np.ma.array(res, mask=result.mask, copy=False)
        if is_scalar:
            result = result[0]
        return result

def sample_data(shape=(73, 145)):
    """Returns ``lons``, ``lats`` and ``data`` of some fake data."""
    nlats, nlons = shape
    lats = np.linspace(-np.pi / 2, np.pi / 2, nlats)
    lons = np.linspace(0, 2 * np.pi, nlons)
    lons, lats = np.meshgrid(lons, lats)
    wave = 0.75 * (np.sin(2 * lats) ** 8) * np.cos(4 * lons)
    mean = 0.5 * np.cos(2 * lats) * ((np.sin(2 * lats)) ** 2 + 2)

    lats = np.rad2deg(lats)
    lons = np.rad2deg(lons)
    data = wave + mean

    return lons, lats, data


ax = plt.axes(projection=ccrs.Mollweide())
lons, lats, data = sample_data()

norm = norm=MidpointNormalize(midpoint=0.8)
cm = ax.pcolormesh(lons, lats, data, 
            transform=ccrs.PlateCarree(),
            cmap='spectral', norm=norm )

ax.coastlines()
plt.colorbar(cm, orientation="horizontal")
ax.set_global()
plt.show()

生产

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