R“caret”包运行到编译环境错误答案

【问题标题】：R "caret" package running into compile environment errorR“caret”包运行到编译环境错误
【发布时间】：2018-12-02 22:50:03
【问题描述】：

我已尝试寻找答案，但似乎绝对找不到任何解决方案。我最近为 R 安装了“caret”包，但是当我尝试训练任何模型时，它给了我以下错误：

Warning: namespace ‘compiler’ is not available and has been replaced
by .GlobalEnv when processing object ‘sep’
Error in comp(expr, env = envir, options = list(suppressUndefined = TRUE)) : 
  could not find function "makeCenv"

据我所知，这与内置编译器包有关。我看到的大多数答案都提到了 doMC 包，但我认为这与这里无关，因为我没有并行化任何东西。我已经能够在其他机器上成功运行相同的代码，所以我完全不知道问题可能是什么。这是一些导致我出错的示例代码：

library(caret)
fit.knn <- train(Species ~ ., data=iris, method="knn")

我使用什么方法或训练什么数据似乎并不重要。我已经尝试重新安装软件包，并重新安装 R。我在 Windows 上运行 R v.3.3.2，插入符号包是最新版本。任何帮助将不胜感激！

【问题讨论】：

标签： r r-caret

【解决方案1】：

我终于找到了解决这个问题的方法。我一直在使用一种特殊的设置，我将我的库位置设置为一个全局文件夹，这样我就不必每次更新 R 时都将我的所有包从“3.2”文件夹移动到“3.3”文件夹等。我的解决方案有效，但副作用是删除了 Program Files 中的默认库位置（包含基本包的位置）。

这似乎对我所做的一切都很好，所以在我开始使用 caret 之前我从来没有注意到一个问题。但出于某种原因，显然内置的 compiler 包（由 caret 的某些依赖项使用）在该设置下无法正常工作，需要显式引用.libPaths() 中的程序文件库位置。改回默认设置后，一切似乎都正常。

因此，尽管这是一个晦涩难懂的错误，而且人们可能不会遇到这种情况，但对于那些从 Google 来到这里的人，请检查 libPaths() 并确保那里有两个位置：您的用户文件夹（在“我的文档”中默认）和包含所有基本包的默认库位置（在“程序文件”中）。

【讨论】：

我在使用 Caret 包时遇到了同样的问题，可以通过更新 Rstudio 并安装比最新版本旧的 Caret 版本来解决它。