Metafor 测量参数错误答案

【问题标题】：Metafor measure argument errorMetafor 测量参数错误
【发布时间】：2015-02-26 04:06:17
【问题描述】：

我已经以我想要的方式计算了效果大小并汇集了 SE。唯一的事情是绘制森林图并让 metafor 计算汇总效果大小。我有 30 多个 .csv 数据文件要单独绘制。当我使用以下数据（如下）执行此操作时，它会平滑地绘制和计算摘要效果。

DeltaPI            Spooled
-75.35224985    7.618629848
-51.85221078    7.513461236
-37.77455275    7.164279414

我使用的线路是：

meta1<-rma(yi=mydata$DeltaPI, sei=mydata$Spooled)
forest(meta1,slab=paste(mydata$Study,mydata$Genotype..Experimental.),showweight=TRUE,alim=c(-100,25),at=c(-100,-50,0,25),xlab="Percentage Change of PI Score",cex=0.7,cex.lab=1,col="red")

但是，当我尝试对我拥有的其他一些 .csv 文件执行相同操作时，rma 会给出错误并要求使用“测量”参数来绘制输出。而且由于该度量已经是我手动计算的 DeltaPI，我不想使用。

奇怪的是，即使我将那些不工作的文件中的数据更改为正常工作的文件（上面的 3 个数据行），它仍然会给出相同的错误。虽然，相同的数据在其他一些 .csv 文件中也能正常工作。

所以我不清楚为什么会出现错误以及解决方案是什么。

任何评论将不胜感激！

【问题讨论】：

标签： r csv

【解决方案1】：

我的猜测是这与绘图无关，而是在运行rma() 命令时发生。在我看来，在您正在读取的数据中如何命名变量存在问题。现在您正在从 .csv 文件中读取数据，但这可能是正在发生的事情：

> library(metafor)
> dat <- data.frame(DeltaP1 = c(.2,.4), Spooled=c(.1,.1))
> rma(dat$DeltaPI, sei=dat$Spooled)

Error in rma(dat$DeltaPi, sei = dat$s) : 
  Specify the desired outcome measure via the 'measure' argument.

所以，本质上，你应该仔细检查变量名。

【讨论】：