【发布时间】:2016-11-24 01:58:22
【问题描述】:
我有这段代码(我很抱歉,它几乎是我工作代码的完全复制粘贴。我不知道问题可能出在哪里,因此我把它全部放在这里):
def init(Q):
"""Serves to initialize the queue across all child processes"""
global q
q = Q
def queue_manager(q):
"""Listens on the queue, and writes pushed data to file"""
while True:
data = q.get()
if data is None:
break
key, preds = data
with pd.HDFStore(hdf_out, mode='a', complevel=5, complib='blosc') as out_store:
out_store.append(key, preds)
def writer(message):
"""Pushes messages to queue"""
q.put(message)
def reader(key):
"""Reads data from store, selects required days, processes it"""
try:
# Read the data
with pd.HDFStore(hdf_in, mode='r') as in_store:
df = in_store[key]
except KeyError as ke:
# Almost guaranteed to not happen
return (key, pd.DataFrame())
else:
# Executes only if exception is not raised
fit_df = df[(df.index >= '2016-09-11') & \
(df.index < '2016-09-25') & \
(df.index.dayofweek < 5)].copy()
pre_df = df[(df.index >= '2016-09-18') & \
(df.index < '2016-10-2') & \
(df.index.dayofweek < 5)].copy()
del df
# model_wrapper below is a custom function in another module.
# It works fine.
models, preds = model_wrapper(fit_df=fit_df, pre_df=pre_df)
if preds is not None:
writer((key, preds))
del preds
return (key, models)
def main():
sensors = pd.read_csv('sens_metadata.csv', index_col=[0])
nprocs = int(cpu_count() - 0)
maxproc = 10
q = Queue()
t = Thread(target=queue_manager, args=(q,))
print("Starting process at\t{}".format(dt.now().time()))
sys.stdout.flush()
t.start()
with Pool(processes=nprocs, maxtasksperchild=maxproc, initializer=init,
initargs=(q,)) as p:
models = p.map(reader, sensors.index.tolist(), 1)
print("Processing done at\t{}".format(dt.now().time()))
print("\nJoining Thread, and finishing writing predictions")
sys.stdout.flush()
q.put(None)
t.join()
print("Thread joined successfully at\t{}".format(dt.now().time()))
print("\nConcatenating models and serializing to pickle")
sys.stdout.flush()
pd.concat(dict(models)).to_pickle(path + 'models.pickle')
print("Pickled successfully at\t{}".format(dt.now().time()))
if __name__ == '__main__':
main()
这段代码的行为就像一次严重的抛硬币。大多数时候它不起作用,有时它起作用。当它运行时,我知道完成整个数据的运行大约需要 2.5 小时(所有 keys)。 10 次运行 9 次,它将处理所有数据,我看到 hdf_out 文件中的数据,但多处理池没有加入。所有子进程都处于活动状态,但不做任何工作。我只是不明白为什么程序会这样挂起。
发生这种情况时,我看不到 "Processing done at ..." 和 "Joining Thread, ..." 消息。此外,如果我给它更小的数据集,它就会完成。如果我排除preds 的计算,它就完成了。我不能在不进行大量修改的情况下排除models 的计算,这将不利于项目的其余部分。
我不知道为什么会发生这种情况。我正在使用 Linux (Kubuntu 16.04)。
【问题讨论】: