避开ggplot中median_hilow的垂直线答案

【问题标题】：Dodging vertical lines for median_hilow in ggplot避开ggplot中median_hilow的垂直线
【发布时间】：2019-06-20 17:17:42
【问题描述】：

我需要在多个样本中绘制显示 3 次重复的中值和 IQR 的线。

数据：

sampleid <- rep(1:20, each = 3)
replicate <- rep(1:3, 20)
sample1 <- seq(120,197, length.out =  60)
sample2 <- seq(113, 167, length.out = 60)
sample3 <- seq(90,180, length.out = 60)

到目前为止我做了什么？

df <- as.data.frame(cbind(sampleid,replicate,sample1, sample2, sample3))

library(reshape2) 

long <- melt(df,id.vars = c('sampleid', 'replicate')) 

ggplot(data = long, aes(x = variable, y = value, colour = factor(replicate)))   + stat_summary(fun.data=median_hilow, conf.int=.5)

但是，对于每个样本，我得到的复制品的 IQR 图相互重叠。我想找到一种“躲避”这 3 条线的方法，使它们彼此相邻可见，而无需更改我已实现的绘图的其他参数。这可以实现吗？

【问题讨论】：

标签： r ggplot2

【解决方案1】：

您必须将jitter 介绍给这些行：

ggplot(data = long, aes(x = variable, y = value, colour = factor(replicate))) +
  stat_summary(fun.data=median_hilow, fun.args = (conf.int=.5), position = "jitter")

请注意，您还需要将conf.int=5 包裹在fun.args 中。

或者，将您的 x 更改为 factor(replicate) 并添加 facet_wrap：

ggplot(data = long, aes(x = factor(replicate), y = value, colour = factor(replicate))) +
  stat_summary(fun.data=median_hilow, fun.args = (conf.int=.5)) +
  facet_wrap(~variable)

【讨论】：

感谢您的启发；我离我想要的很近。但是关于为什么这些线随机出现在不同样本的处理中的任何逻辑？是否可以让这些行按顺序出现，即处理 1、2 和 3，并且间距也相等？
您正在使用x = variable 进行绘图。这意味着您在sample1、sample2 和sample3 上绘图，并且这些线条都与这些线条很好地对齐。通过添加jitter，您可以将它们区分开来。但是，jitter 添加了一个随机数。
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