在散景的右轴上绘图

Question

我正在构建一个多类别箱线图，但无法将箱线图对齐到正确的位置。

我的基因 x 轴由数据库细分。但是我的情节把所有的东西都画在了基因的中间。

我的轴是这样的：

x = sorted(list(set([(gene, database) for gene in totaldf['gene'].to_list() for database in totaldf['db'].to_list()])))
p = figure(background_fill_color="#efefef", x_range=FactorRange(*x), width=1600, height=700)

我尝试像这样绘制我的盒子：

p.vbar(x=(gene, db), width=0.7, bottom=q2[gene, db], top=q3[gene, db], fill_color="#ffffff", line_color="black")
p.vbar(x=(gene, db), width=0.7, bottom=q1[gene, db], top=q2[gene, db], fill_color="#ffffff", line_color="black")

这导致我的绘图如下所示： https://imgur.com/a/8Q8YC1N

如何将情节放置在正确的位置？数据框如下所示：

      gene       db  mutations
0     IGHV1-3  G1K_CL2          6
1    IGHV1-58  G1K_CL2          2
2    IGHV1-58  G1K_CL2          3
3     IGHV1-8  G1K_CL2          2
4    IGHV3-16  G1K_CL2          3
..        ...      ...        ...
141  IGHV4-61  G1K_CL3         11
142  IGHV4-61  G1K_CL3         12
143  IGHV4-61  G1K_CL3         10
144  IGHV4-61  G1K_CL3         13
145  IGHV7-81  G1K_CL3          4

Answer 1

gene 和 db 是 DataFrame 中的列吗？未以正确的格式提供坐标。您提供的是 2 元组列表，但需要的是 2 元组列表。坐标列表应如下所示：

x=[(gene1, db1), (gene2, db2), ...])

zip(gene, db) 可能会提供您想要的。

话虽如此，我还强烈建议在处理嵌套分类数据时使用显式创建的ColumnDataSource。可能会出现一些固有的歧义，而自己构建 CDS 可以消除这些歧义。