图表不同部分的颜色可视化

【问题标题】：Color visualization for different parts of a diagram图表不同部分的颜色可视化
【发布时间】：2016-06-09 02:08:20
【问题描述】：

我有一些植物根部不同部位的基因表达数据（见图），我想展示根部不同部位的基因表达水平。例如，如果基因在顶端分生组织中高度表达，我想将示意图的顶端分生组织部分标记为红色。一种可能性是将图表制作成地图，有没有人有任何建议如何在 R 中将图表制作成地图？或者，如果您知道任何用于此目的的工具，请告诉我。谢谢！

The plant root structure

【问题讨论】：

SO 只接受光栅图像文件，但如果您的原件具有实际结构，您可以为单个多边形着色。

标签： r

【解决方案1】：

您可以使用the raster package 绘制自己的多边形来分隔区域。或者，this post 可能会提供更好的方法来做到这一点。

然后，您可以在多边形内创建热图和颜色。说，ggplot2::geom_polygon()

为了让它看起来更好，你可以使用原始图像作为背景，然后用一些透明度覆盖你的热图（即ggplot2中的alpha参数），这样你就可以看到彩色的热图和一些原始图像。更多详情请查看this post，如果您喜欢有趣的图片，请查看this post

【讨论】：

非常感谢，BarkelyBG！人体贴是我需要的，因为我有一个用于细胞形状的 SVG 文件。