如何使用 pandas 访问 hdf5 中的嵌套表

Question

我想使用 pandas 从 HDF5 文件中检索表。

根据我找到的几个参考资料，我尝试使用以下方法打开文件：

df = pd.read_hdf('data/test.h5', g_name), 

其中 g_name 是我要检索的对象的路径，即表 TAB1，例如 MAIN/Basic/Tables/TAB1。

g_name 检索如下：

def get_all(name):
    if 'TAB1' in name:
        return name

with h5py.File('data/test.h5') as f:
    g_name = f.visit(get_all)
    print(g_name)
    group = f[g_name]
    print(type(group))

我也尝试过检索对象本身，如上面的代码 sn-p 所示，但对象类型是 我如何将其转换为可以在熊猫中读取为数据框的内容？

对于第一种情况，我收到以下错误： "如果对象不存在，则无法创建存储"

如果路径与搜索期间检索到的路径相同，我不明白为什么找不到对象。

Answer 1

我找到了以下解决方案：

hf = h5py.File('data/test.h5')
data = hf.get('MAIN/Basic/Tables/TAB1')
result = data[()]

# This last step just converts the table into a pandas df
df = pd.DataFrame(result)