netcdf4-python：读取变量存储参数答案

【问题标题】：netcdf4-python: Reading variable storage parametersnetcdf4-python：读取变量存储参数
【发布时间】：2020-10-30 21:33:29
【问题描述】：

我试图手动将 NetCDF 文件的所有维度、变量和属性复制到新文件中。与copy netcdf file using python 一样，这很好用，除了'fill_value' 或'chunksized' 之类的存储参数。在ncdump -sch 中，这些参数以前导下划线 (_) 显示：

    float var1(time, lat, lon) ;
        var1:_FillValue = NaNf ;
        var1:grid_mapping = "crs" ;
        var1:unit = "m" ;
        var1:_Storage = "chunked" ;
        var1:_ChunkSizes = 1, 14, 146 ;
        var1:_DeflateLevel = 9 ;
        var1:_Shuffle = "true" ;
        var1:_Endianness = "little" ;

在createVariable 中，我可以为新变量设置这些参数，但是如何使用 netcdf4-python 模块从现有文件中获取“fill_value”或“chunksize”等参数？读取这些参数的语法是什么？

【问题讨论】：

标签： python netcdf4

【解决方案1】：

有关块大小的信息，您可以对变量使用chunking() 方法。不幸的是，如果 _FillValue 设置为非默认值，您似乎只能访问它：

from netCDF4 import Dataset
import numpy as np

nc = Dataset('data.nc', 'w')
nc.createDimension('t', 10)
var = nc.createVariable('temp', 'f', ('t',), fill_value=80)
var[:] = np.arange(10)
nc.close()

nc_read = Dataset('data.nc')
temp = nc_read.variables['temp']
print(temp.chunking())
print(temp._FillValue)

所以现在看起来处理填充值的最简单方法是：

fill = getattr(temp, '_FillValue', mydefaultvalue)

可能值得在 GitHub 上游打开一个问题。

【讨论】：

【解决方案2】：

谢谢你，这就像一个魅力！我已经解决了一个未定义的_FillValue 的处理，现在就像：

try: fillVal = variable._FillValue
except: fillVal = netCDF4.default_fillvals[str(variable.dtype.kind)+str(variable.dtype.itemsize)]

看起来有点复杂，但似乎dtype 没有default_fillvals 的预期输入的输出格式方法

【讨论】：