LHAPDF：在 Python 中运行时未定义的符号答案

【问题标题】：LHAPDF: undefined symbol when running in PythonLHAPDF：在 Python 中运行时未定义的符号
【发布时间】：2017-10-18 20:18:58
【问题描述】：

我正在尝试使用LHAPDF 的 Python 接口，但收到以下错误消息：

Traceback (most recent call last):
  File "test.py", line 2, in <module>
    import lhapdf
ImportError: /home/n17182559/LHAPDF/lib/python2.7/site-packages/lhapdf.so: undefined symbol: _ZN6LHAPDF6ConfigD1Ev

我在 Ubuntu 17.04 上运行，使用 Python 2.7，安装了 Boost，并且有一个可以工作的 C++ 编译器 (g++)。我相信我已经成功安装了 LHAPDF，因为我按照他们网站上的说明进行操作并且没有收到错误消息（仅警告 auto_ptr 已被弃用，但我认为我无法控制它）。我确实将 ~/LHAPDF/lib/python2.7/sitepackages/ 目录添加到 $PYTHONPATH 并将 ~/LHAPDF/bin/ 目录添加到 $PATH。我正在使用 LHAPDF 6.1.6（撰写本文时的最新版本）。

我从仅包含的 test.py 文件中收到此错误消息

#!/usr/bin/python
import lhapdf

如果它可以帮助你帮助我，我找到了一个similar problem 的人，但原因似乎不一样（我没有安装 Anaconda）。当他们通过从 $PATH 中删除 Anaconda 解决了他们的问题时，这里是我的 $PATH 和 $PYTHONPATH 因为它们可能是问题的根源（虽然我不知道如何）：

$PATH
/home/n17182559/LHAPDF/bin:/opt/applications/geant4/geant4.10.02-install/bin:/home/n17182559/ROOT/bin:/usr/local/sbin:/usr/local/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/sbin:/bin:/usr/games:/usr/local/games:/snap/bin:

$PYTHONPATH
/home/n17182559/ROOT/lib:/home/n17182559/LHAPDF/lib/python2.7/site-packages:

希望大家帮忙！

【问题讨论】：

问题是主 LHAPDF lib 目录没有链接到我的 LD_LIBRARY_PATH。 export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/LHAPDF/lib/libLHAPDF.so 解决了它，如果有人需要解决方案。

标签： python c++ linux python-2.7 ubuntu

【解决方案1】：

如果有人想要解决方案，我已经解决了（在外部帮助下）。问题是主 LHAPDF lib 目录没有链接到我的 LD_LIBRARY_PATH。这个命令行解决了它：

export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/LHAPDF/lib/libLHAP‌DF.so

（我添加到我的 ~/.bashrc 文件中）。

【讨论】：

太棒了！我希望它会这么直接。

【解决方案2】：

我无法谈论您的具体问题，但是当我收到此类错误时，它源于包之间的版本不匹配：lhapdf 依赖于另一个包来定义那个神秘的“半隐藏”符号，但是它所依赖的包的版本与预期的不同；旧/新版本不提供该符号。

【讨论】：

感谢您的帮助！我只是想尝试一下，但后来其他人（stackoverflow 之外）告诉我问题出在哪里，现在已经解决了（请参阅我对原始帖子的评论）。
太棒了！请记住对有用的东西进行投票并接受您最喜欢的答案（即使您必须自己编写），以便 Stack Overflow 可以正确存档问题。我们希望它成为有用的、可搜索答案的存储库。
好的，感谢您的提示！我实际上赞成你的回答，因为它对可能有类似问题的人来说是快速、相关和有用的，但我的赞成票没有出现，因为我的声誉仍然太低：P。
我知道；我认为你必须达到 50 分。作为发帖人，您仍然应该接受您的回答。
是的，我刚刚做到了，我必须等一天才能做到。

【解决方案3】：

这是（Python的）版本不匹配，可能是安装LHAPDF后升级Python造成的。

因此，您可能需要重新安装 LHAPDF，或者如果您使用两个版本的 Python，您可以安装第二个 LHAPDF（目前我不知道除此之外的解决方案）。

让我们假设您使用 6.2 或更高版本的 LHAPDF，这要简单得多。首先，您想在 shell 配置文件中设置路径，使其指向您要为其安装 LHAPDF 的 Python 版本。对于bash，你可以这样做

export PATH=path/to/python

那么你想关注instruction并做

tar xf LHAPDF-6.X.Y.tar.gz
cd LHAPDF-6.X.Y
./configure --prefix=/path/for/installation
make
make install

安装完成后，可以将LHAPDF添加到路径中

export PYTHONPATH=path/to/lhapdf/lib/pythonx.y/site-packages/
export LD_LIBRARY_PATH=path/to/lhapdf/lib
export PATH=path/to/lhapdf/bin/:$PATH
export LHAPDF_DATA_PATH=path/to/lhapdf/share/LHAPDF

【讨论】：