用于 HL7-FHIR 的 Mongodb答案

【问题标题】：Mongodb for HL7-FHIR用于 HL7-FHIR 的 Mongodb
【发布时间】：2017-02-03 17:14:06
【问题描述】：

学习 FHIR 并尝试使用使用 MongoDb 作为数据库的 MEAN 堆栈来实现，我想就我的问题寻求您的帮助。

当我收到新资源文档的 POST 请求时，我会将其插入 MongoDB。由于 MongoDB 会将 _id（对象 ID）作为唯一 ID 添加到资源中。当我检索文档时，它将具有额外的字段 _id。我认为这会使资源不再合规，因为资源中没有定义_id。

我可以知道如何处理这个问题吗？这个额外的 _id 在 FHIR 资源中是否重要？

最好的问候，自动运行

【问题讨论】：

标签： mongodb hl7-fhir

【解决方案1】：

所以，我还使用 MongoDB - 以及 mongoose - 在 nodejs 中实现 FHIR。我刚刚在 mongoose 的模式定义中添加了一个名为 id 的字段，就像这样

import mongoose from 'mongoose';
import shortid from 'shortid';
class resource extends mongoose.Schema {
  constructor(schema) {
    super();
    this.add({
      // just added this to make MongoDB use shortid
      _id: { type: String, default: shortid.generate },
      id: { type: {} },
      id_: { type: {} },
      implicitRules: { type: String },
      implicitRules_: { type: {} },
      language: { type: String },
      language_: { type: {} },
      ...schema
    });
  }
}
export default resource;

然后_id 字段在创建/更新资源时从id 获取其值

我用于更新患者资源的代码

upsert(root, params, context, ast) {
    const projection = this.getProjection(ast);
    if (!params.data.id) {
      params.data.id = shortid.generate();
    }
    params.data.resourceType = 'Patient';
    const upserted = model
      .findByIdAndUpdate(params.data.id, params.data, {
        new: true,
        upsert: true,
        select: projection
      })
      .exec();

    if (!upserted) {
      throw new Error('Error upserting');
    }
    return upserted;
  }

【讨论】：

【解决方案2】：

是的，_id 将不符合要求。不能改成'id'？

【讨论】：

谢谢格雷厄姆。感恩节快乐。 Mongo 使用 _id。而且，它在顶层，但不在标识符子组件之下。
所以它和我们所说的“id”是一样的，但名称不同？
是的，id和_id类似。我正在集思广益，将诸如患者资源之类的资源仅作为 Mongo 文档的一部分。一份文件包含 3 个主要部分。 1. _id 是资源 ID，而不是业务患者 ID，2. 跟踪历史记录或必要资源限定符的元数据，3. 实际资源。 Patient 资源中的标识符数组将包含资源 id (_id) 和患者 MRN。但是，通过这样做，单个“创建”操作将分为 2 个操作 - 添加，然后使用“标识符”下的新资源 ID 进行更新
我在 Mongo 中存储单个资源的转储想法 - { _id: Object_id, _history: history_record, _metadata: other_metadata, fhir_resource: fhir_resource }。在 FHIR 资源中，根据规范，我将有一个标识符数组，可以是驾驶执照、医疗记录号以及 Mongo 资源 id，即 _id。

【解决方案3】：

也许你可以看看Spark server，它也使用了一个MongoDB来存储资源。在 Spark.Store.Mongo 命名空间中，您将看到一些帮助方法将 Mongo BSONdocument 转换为 FHIR 资源。

【讨论】：

谢谢米贾姆。我会研究它，但我对 C# 了解不多。
好吧，没问题，我希望你能看到我们如何从 MongoDB 中取出那个文档，并在我们使用其余数据之前取出 Mongo 添加的额外字段。