如何并行运行 MATLAB 脚本（即在多个内核上且不使用 parfor）？

Question

我正在寻找并行运行 MATLAB 脚本的选项，而不会带来太多麻烦。

有没有例子或简单的场景说明在这种情况下如何进行？

Answer 1

以下注释假定为 MacOSX/Linux。但是parallel 可以在 Windows 上像 msys 这样的环境中工作

这是一个关于如何在您的计算机上并行启动 MATLAB 作业的示例（不使用 parfor 或需要依赖 Parallel Toolbox 许可证）：

seq 1 4 | parallel 'matlab -singleCompThread -nojvm -r "myprint({}); exit"'

其中myprint.m 是以下 MATLAB 函数（放置在当前工作目录中）：

cat myprint.m 
function myprint(text)
   disp(text)
end

可以使用 Octave 复制此行为：http://www.gnu.org/software/octave/

seq 1 4 | parallel 'octave --eval "myprint({}); exit"'

parallel 应该被安装。有关该工具的更多信息，请访问 GNU 项目主页：http://www.gnu.org/software/parallel/man.html

一些展示最常见用法的短视频可在以下网址获得：http://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1。如果您喜欢 Ogg/Theora 格式的视频：http://tinyogg.com/watch/TORaR/ 和 http://tinyogg.com/watch/hfxKj/

替代方法 - 编译 MATLAB 代码

另一种避免依赖 Parallel Toolbox 许可证的方法是编译成如下代码

mcc -m myprint.m

如果一切正常（即编译时没有任何错误），您将看到一个 myprint 可执行文件和一个 bash 脚本。要运行脚本，只需在终端中执行以下操作：

run_myprint.sh

查找 MATLAB 的安装位置（使用 $MATLABROOT bash 变量或 $MCR [MATLAB 运行时文件夹]）。你现在可以开始你的程序了：

./run_myprint.sh /usr/local/MATLAB/R2010b 2

你会看到

------------------------------------------
Setting up environment variables
---
LD_LIBRARY_PATH is .:/usr/local/MATLAB/R2010b/runtime/glnxa64:/usr/local/MATLAB/R2010b/bin/glnxa64:/usr/local/MATLAB/R2010b/sys/os/glnxa64:/usr/local/MATLAB/R2010b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/native_threads:/usr/local/MATLAB/R2010b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/server:/usr/local/MATLAB/R2010b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64/client:/usr/local/MATLAB/R2010b/sys/java/jre/glnxa64/jre/lib/amd64
2

并行运行编译后的 MATLAB 代码的并行 bash 版本如下所示：

seq 1 4 | parallel './run_myprint.sh /usr/local/MATLAB/R2010b {}'

忠告

如果您的问题以及因此您的代码是令人尴尬的并行，请保持这种方式。

parfor 只有真正需要解耦数据中的依赖关系：

点击此处了解更多详情：http://en.wikipedia.org/wiki/Embarrassingly_parallel