在计算 R 中基于 95% 似然的置信区间时，我想用 gamma 函数替换指数函数

Question

我想替换指数对数似然

explik <- function(x) {

  sum( dexp(data, 1/x, log=TRUE))
}

伽马负对数似然

gammalike <- function(x) {
  
  -sum(dgamma(data, shape=x, scale=2, log=TRUE))
}

在下面的函数和脚本中

likeqn <- function(mu) {
  
  muhat <- mean(data)
  maxlik <- explik(muhat)
  explik(mu) - maxlik + 0.5 * 3.841
}

source("explik.R")
source("likeqn.R")


# Input data
data <- c(63, 130, 88, 120, 330, 188, 270, 222, 189, 116)

# Find the MLE of an exponential distribution
muhat <- mean(data)

# Solve likelihood equation numerically to find likelihood based CI
vlikeqn <- Vectorize(likeqn)
CIlower <- uniroot(vlikeqn, c(10,muhat) )$root
CIupper <- uniroot(vlikeqn, c(muhat,500) )$root
cbind(CIlower, muhat, CIupper)

# Plot log-likelihood function
x <- seq(80, 350)
vexplik <- Vectorize(explik)
plot(x, vexplik(x), type="l", xlab=expression(mu), ylab="log-likelihood")

我尝试替换 log-like 函数，但结果似乎不合理。

Answer 1

具有速率 lambda 的分布 Expo(lambda) 是 Gamma(1, 1/lambda)（形状尺度）。

gammalike <- function(x) {
  sum(dgamma(data, shape=1, scale=x, log=TRUE))
}