【发布时间】:2012-03-05 10:01:13
【问题描述】:
我有一个与 SWIG 完美配合的小项目。特别是,我的一些函数返回std::vectors,它被翻译成Python 中的元组。现在,我做了很多数字,所以我只是让 SWIG 在它们从 c++ 代码返回后将它们转换为 numpy 数组。为此,我在 SWIG 中使用了类似以下的内容。
%feature("pythonappend") My::Cool::Namespace::Data() const %{ if isinstance(val, tuple) : val = numpy.array(val) %}
(实际上,有几个名为 Data 的函数,其中一些返回浮点数,这就是为什么我检查 val 实际上是一个元组。)这很好用。
但是,我还想使用现在可用的 -builtin 标志。对这些 Data 函数的调用很少见,而且大多是交互式的,因此它们的速度慢不是问题,但是还有其他慢速循环可以通过内置选项显着加快速度。
问题在于,当我使用该标志时,pythonappend 功能会被忽略。现在,Data 再次返回一个元组。有什么办法我仍然可以返回 numpy 数组?我尝试使用类型映射,但结果变得一团糟。
编辑:
Borealid 很好地回答了这个问题。为了完整起见,我包含了一些我需要的相关但略有不同的类型映射,因为我通过 const 引用返回并且我使用向量的向量(不要开始!)。这些差异很大,我不希望其他人在试图找出细微差别时磕磕绊绊。
%typemap(out) std::vector<int>& {
npy_intp result_size = $1->size();
npy_intp dims[1] = { result_size };
PyArrayObject* npy_arr = (PyArrayObject*)PyArray_SimpleNew(1, dims, NPY_INT);
int* dat = (int*) PyArray_DATA(npy_arr);
for (size_t i = 0; i < result_size; ++i) { dat[i] = (*$1)[i]; }
$result = PyArray_Return(npy_arr);
}
%typemap(out) std::vector<std::vector<int> >& {
npy_intp result_size = $1->size();
npy_intp result_size2 = (result_size>0 ? (*$1)[0].size() : 0);
npy_intp dims[2] = { result_size, result_size2 };
PyArrayObject* npy_arr = (PyArrayObject*)PyArray_SimpleNew(2, dims, NPY_INT);
int* dat = (int*) PyArray_DATA(npy_arr);
for (size_t i = 0; i < result_size; ++i) { for (size_t j = 0; j < result_size2; ++j) { dat[i*result_size2+j] = (*$1)[i][j]; } }
$result = PyArray_Return(npy_arr);
}
编辑 2:
虽然不是我想要的,但类似的问题也可以使用@MONK 的方法 (explained here) 来解决。
【问题讨论】:
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我认为如果不编写类型映射并在 C 端执行此操作,您将无法做到这一点,这正是因为 -builtin 删除了通常放置 pythonappend 的代码。你确定 -builtin 更快(即分析是否引导你使用它?)我很想使用两个模块,一个有 -builtin 一个没有。
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我很惊讶没有警告
-builtin忽略 pythonappend。我无法应对将std::vectors 类型映射到 numpy 数组的挑战。我做了配置文件,它显着加速了我界面中最烦人的循环(没有足够长的时间来休息;太长而不能经常等待)。但我也意识到我可以将这个循环移动到我的 c++ 代码中——虽然有点尴尬。所以我就这样走了。不过,您的“两个模块”建议很有趣,并且可能在其他情况下有用。 -
您是否使用 -Wall 调用了 SWIG?我认为在这种情况下它会发出警告。
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没有警告,即使是
-Wall(尽管这是一个足够大的忽略,我认为它甚至不需要这样做)。 -
尝试用 Cython 包装
Data方法?