尺寸=0 的线仍由 geom_line 绘制

Question

所以我有一个data.frame 某些物种随时间的活动。这是其中的一部分：

df <- structure(list(soort_wet = structure(c(2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 
        2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 
        2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 
        2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L, 2L, 1L), .Label = c("Callophrys rubi", 
            "Coenagrion hastulatum"), class = "factor"), periode = structure(c(1L, 
                            1L, 2L, 2L, 3L, 3L, 4L, 4L, 5L, 5L, 6L, 6L, 7L, 7L, 8L, 8L, 9L, 
                            9L, 10L, 10L, 11L, 11L, 12L, 12L, 13L, 13L, 14L, 14L, 15L, 15L, 
                            16L, 16L, 17L, 17L, 18L, 18L, 19L, 19L, 20L, 20L, 21L, 21L, 22L, 
                            22L, 23L, 23L, 24L, 24L, 25L, 25L), .Label = c("1-mrt", "10-mrt", 
                  "20-mrt", "1-apr", "10-apr", "20-apr", "1-mei", "10-mei", "20-mei", 
                  "1-jun", "10-jun", "20-jun", "1-jul", "10-jul", "20-jul", "1-aug", 
                  "10-aug", "20-aug", "1-sep", "10-sep", "20-sep", "1-okt", "10-okt", 
                  "20-okt", "30-okt"), class = "factor"), activiteit = c(NA, NA, 
                    NA, NA, NA, NA, NA, NA, 0, NA, 1, 0, 1, 1, 3, 2, 3, 3, 3, 3, 
                    3, 3, 1, 2, 1, 2, 0, 1, 0, 1, NA, 1, NA, 0, NA, NA, NA, NA, NA, 
                   NA, 0, NA, 0, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA)), .Names = c("soort_wet", 
                   "periode", "activiteit"), class = "data.frame", row.names = c(9L, 
                           15L, 70L, 76L, 131L, 137L, 192L, 198L, 253L, 259L, 314L, 320L, 
                           375L, 381L, 436L, 442L, 497L, 503L, 558L, 564L, 619L, 625L, 680L, 
                           686L, 741L, 747L, 802L, 808L, 863L, 869L, 924L, 930L, 985L, 991L, 
                           1046L, 1052L, 1107L, 1113L, 1168L, 1174L, 1229L, 1235L, 1290L, 
                           1296L, 1351L, 1357L, 1412L, 1418L, 1473L, 1479L))

如您所见，我已将活动分为 4 类（0 到 3）。现在我想绘制一个图表，将活动显示为一条线。我为此使用 ggplot2：

library(ggplot2)

# First attempt: size = 0 is still plotted as a line
ggplot(df, aes(x=periode,y=soort_wet, group=soort_wet)) +
  geom_line(aes(size=activiteit))

嗯，这几乎就是我想要的，除了：我想要带有 acitiviteit==0 的线条，因此不绘制 size==0。 所以我的第一个问题是为什么要绘制 size==0 的线条，我该如何解决这个问题？ 请注意，我不想用 NA 替换 0，因为这会导致我的行过早结束。

我想我可以自己解决这个问题，将这些线条设为白色（或 colour=NA）：

ggplot(df, aes(x=periode,y=soort_wet, group=soort_wet)) +
  geom_line(aes(size=activiteit,colour=ifelse(activiteit==0,NA,"black")))

但这让我陷入了更深的麻烦。有谁知道为什么这不起作用（奖金问题！）。

Answer 1

诚然，这样做有点烦人。让我回顾一下您尝试中的一些内容，以及为什么它没有首先起作用。

首先，简单地声明 size=activiteit 并不意味着值为 0 将导致大小为 0。ggplot 首先进行缩放，默认情况下在大小 1 和 6 之间。如果你想映射到实际值，你必须使用scale_size_identity() 或调整scale_size_continuous 中的range。不幸的是，调整它会产生更好的图表，但由于我也不明白的原因，这条线仍然可见。

接下来，您的第二次尝试也不起作用，因为您现在正在映射值 'black'（这种方法适用于基础 R）。

现在，为了解决所有这些问题，我们可以在activiteit == 0 时创建一个新变量TRUE，并将该变量映射到alpha，这样我们就可以使该行的那部分透明。

示例代码：

df$alp <- ifelse(df$activiteit == 0, T, F)

ggplot(df, aes(x=periode,y=soort_wet, group=soort_wet, alpha=alp)) +
  geom_line(aes(size=activiteit)) + theme_bw() +
  scale_alpha_manual(values = c("TRUE" = 0, "FALSE" = 1), guide = 'none') +
  scale_size_continuous(range = c(0, 15)) +
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1, vjust = 0.5))

结果：

编辑：

我刚刚意识到还有一种更简单的方法，您可以将大小比例的限制调整为不包括 0：

ggplot(df, aes(x=periode,y=soort_wet, group=soort_wet)) +
  geom_line(aes(size=activiteit)) + theme_bw() +
  scale_size_continuous(range = c(3, 15), limit = c(1, 3)) +
  theme(axis.text.x = element_text(angle = 90, hjust = 1, vjust = 0.5))

Answer 2

这对你有用吗？

根据需要先设置子集

df_s <- df %>% filter(activiteit > 0)

然后绘制

ggplot(df_s, aes(x=periode,y=soort_wet, group=soort_wet)) +
  geom_line(aes(size=as.factor(activiteit)))

你的尺寸为 0 不是情节。