在 php 代码中调用时无法识别 R 库路径答案

【问题标题】：R library path is not recognised when invoked in php code在 php 代码中调用时无法识别 R 库路径
【发布时间】：2017-08-16 15:54:39
【问题描述】：

我想知道为什么我使用以下代码 (mytable.R) 生成的数据表在 php 代码中使用时无法使用 saveWidget 参数保存 html 文件。

library(DT)
load.this <- "DT"
data <- as.matrix(read.table("/path/to/file.txt", header = TRUE, fill = TRUE))

table <- datatable(data, filter = 'top', options = list(columnDefs = list(list(targets = c(1, 3), searchable = FALSE)),pageLength = 10))     

saveWidget(table, "test.html", selfcontained = TRUE, libdir = NULL,
       background = "white", knitrOptions = list())

调用 mytable.R 的 PHP 代码是，

echo exec("Rscript /var/www/html/fam/R/mytable.R $size");

但是，从终端发出以下命令会生成并保存在目录中的文件。

Rscript mytable.R

或者，1）我尝试了 htmlwidgets 而不是 DT

          2)  saveWidget(table, file="test.html")

在这两种情况下，问题仍然存在。谁能告诉我为什么文件没有保存？

编辑：

我使用以下命令在服务器中安装了 DT 包，

sudo R
install.packages("DT", lib = "/usr/local/lib/R/site-library/")

【问题讨论】：

标签： php r apache package

【解决方案1】：

这是 DT 包依赖项的问题。

install.packages("DT", lib = "/usr/local/lib/R/site-library/", dependencies = TRUE)

无法识别包裹。但是，当我手动从列表here 加载每个包时，它是成功的。

【讨论】：