PostGIS 几何保存：“遇到无效的字节序标志值。”答案

【问题标题】：PostGIS Geometry saving: "Invalid endian flag value encountered."PostGIS 几何保存：“遇到无效的字节序标志值。”
【发布时间】：2012-08-31 12:17:24
【问题描述】：

我有一个 Spring Roo + Hibernate 项目，它从客户端应用程序获取 JTS 知名文本 (WKT) 字符串输入，将其转换为 JTS Geometry 对象，然后尝试将其写入 PostGIS 数据库。我对the JDBC connection and types 有一些问题，但这些问题似乎已通过以下方式解决：

@Column(columnDefinition = "Geometry", nullable = true) 
private Geometry centerPoint;

转换确实如此：

Geometry geom = new WKTReader(new GeometryFactory(new PrecisionModel(), 4326)).read(source);

但是现在当 Hibernate 尝试将我的 Geometry 对象写入数据库时，我得到一个错误：

2012-08-31 21:44:14,096 [tomcat-http--18] ERROR org.hibernate.util.JDBCExceptionReporter - Batch entry 0 insert into land_use (center_point, version, id) values ('<stream of 1152 bytes>', '0', '1') was aborted.  Call getNextException to see the cause.
2012-08-31 21:44:14,096 [tomcat-http--18] ERROR org.hibernate.util.JDBCExceptionReporter - ERROR: Invalid endian flag value encountered.

似乎很明显，该错误与二进制表示有关，它可能是生成为带有一些endianness 的众所周知的二进制 (WKB)。然而，由于 Hibernate 隐藏了所有的持久性，我真的无法判断事情的发展方向。

我已经与这个几何问题作斗争好几天了，关于这些错误的信息很少，所以有人有什么好主意吗？我可以在某处（Hibernate 或 PostGIS）指定字节顺序，或者以不同的格式（WKT）存储吗？

编辑：我还应该提到，我使用的是最新的，通常似乎是兼容的：

Spring 3.1.1，Roo 1.2.1
休眠 3.6.9
休眠空间 4.0-M1
jts 1.12
PostgreSQL 9.1
postgis-jdbc 1.5.3（不是最新的，而是recommended for hibernate-spatial，编译自源码）
postgis-jdbc 2.0.1（刚刚尝试了这个来匹配安装PostgreSQL的版本，同样的问题）

Hibernate Spatial 4 tutorial 建议我将属性注释为：

@Type(type="org.hibernate.spatial.GeometryType")
private Geometry centerPoint;

...但是当我这样做时，我得到this other error，当前注释已解决。

【问题讨论】：

您好，我关注您的 OpenGIS 问题 :) 您是否尝试过两次方法 @Type(type="org.hibernate.spatial.GeometryType") 注释加上 JPA 注释 @Column(columnDefinition = "Geometry", nullable = true) 关联到同一字段。
其他库也有类似geodb issue n°5 的问题。我建议你应该试试 postgis 测试套件，看看你是否遇到同样的问题。这看起来像是字节序字符编码的问题，好的，但有时事情不像他们第一眼看到的那样。您是否尝试使用 getNextException() 方法获得更多信息，或者您的日志的第二行就是您能得到的所有信息？
我发现以下java hibernate postgis tutorial 建议按照我所说的去做。它是法语的，好的，但是如果您需要翻译，我可以提供帮助（我是法语，哈哈）。在建议的教程中，它简要解释了我在第一条评论中提到的每个注释的作用。看来您需要按照我的建议进行设置。

标签： spring hibernate geometry endianness jts

【解决方案1】：

我解决了这个问题，添加到 'application.properties' 这一行：

spring.jpa.properties.hibernate.dialect=org.hibernate.spatial.dialect.postgis.PostgisDialect

【讨论】：

它也为我解决了这个问题。我在application.properties 中有hibernate.dialect=... 而不是spring.jpa.properties.hibernate.dialect=...。列的定义是这样的：@Column(columnDefinition = "GEOGRAPHY(POINT)") private com.vividsolutions.jts.geom.Point location;

【解决方案2】：

解决方案似乎如下：
@Column 使用 JPA 注释将字段映射到所需列
@Type 使用方言指定 Hibernate 映射。

@Column(columnDefinition = "Geometry", nullable = true) 
@Type(type = "org.hibernate.spatial.GeometryType")
public Point centerPoint;

您可以在 hibernate.cfg.xml 文件中添加 Hibernate 属性以查看 db 请求并尝试使用基于文本的编辑器（例如带有“UTF-8”/“ANSI”/”的 Notepad++ 来捕获字符串编码问题其他字符集”

<!--hibernate.cfg.xml -->
<property name="show_sql">true</property>
<property name="format_sql">true</property>
<property name="use_sql_comments">true</property>

要添加休眠属性，您将拥有一个包含以下内容的 hibernate.cfg.xml 文件。不要复制/粘贴它，因为它是面向 MySQL 的。看看我在哪里插入了我之前调用的属性。

 <?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
 <!DOCTYPE hibernate-configuration PUBLIC
 "-//Hibernate/Hibernate Configuration DTD 3.0//EN"
 "http://hibernate.sourceforge.net/hibernate-configuration-3.0.dtd">
 <hibernate-configuration>
      <session-factory>
           <property name="hibernate.bytecode.use_reflection_optimizer">true</property>
           <property name="hibernate.connection.driver_class">com.mysql.jdbc.Driver</property>
           <property name="hibernate.connection.password">db-password</property>
           <property name="hibernate.connection.url">jdbc:mysql://localhost:3306/db-name</property>
           <property name="hibernate.connection.username">db-username</property>
           <property name="hibernate.default_entity_mode">pojo</property>
           <property name="hibernate.dialect">org.hibernate.dialect.MySQL5InnoDBDialect</property>
           <property name="hibernate.format_sql">true</property>
           <property name="hibernate.search.autoregister_listeners">false</property>
           **<property name="hibernate.show_sql">true</property>**
           <property name="hibernate.use_sql_comments">false</property>

           <mapping ressource="...." />
           <!-- other hbm.xml mappings below... -->

      </session-factory>
 </hibernate-configuration>

另一种记录所有 sql 的方法是在 log4j.properties 文件中添加特定于包的属性：

log4j.logger.org.hibernate.SQL=DEBUG
log4j.logger.org.hibernate.type=TRACE

祝你好运！

【讨论】：

这肯定解决了字节序问题，所以谢谢。然而，可以预见的是，我现在有另一个内部错误：Could not commit JPA transaction; nested exception is javax.persistence.RollbackException: Error while committing the transaction。堆栈跟踪没有帮助，让休眠配置标签工作比预期的更困难。这对您来说是显而易见的，还是需要一个新问题？
你好，也许正在寻找任何@Transactional 的东西。我今天没有足够的时间（国际象棋活动）。也许我明天可以帮你。我将添加一个完整的休眠配置，以便您查看它。祝你好运！
嗯。也许您的数据库模型不允许您要存储在数据库中的 PostGIS 对象涉及的任何字段为空值。如果您使用断点运行项目并点击F6 以逐步进入您的java 程序，您将看到何时抛出异常。您可以点击F5 进入您想要检查的任何方法。查看使用 eclipse 和您正在使用的容器（Tomcat、JBoss、GlassFish 等）配置远程调试。
另外，未来的读者会注意到那些 hibernate.cfg.xml 标签应该在 hibernate 命名空间中，即 hibernate.show_sql 等。对于 Roo 项目，他们进入 persistence.xml，并且需要将日志记录至少打开到 DEBUG 级别。
请注意，以上解决方案适用于休眠 4，如果您使用休眠 5，请查看piladooo 的回答或我的解释

【解决方案3】：

piladooo 的解决方案适用于 spring boot 2.0.3、hibernate/spatial 5.2.17.Final、Postgres 9.5。

在我的例子中，实体中的列定义为 @Column(name = "几何") 私有几何几何；

并在数据库中作为“几何”类型（以避免休眠自动生成的 bytea 类型）

首先，我通过添加 columnDefinition = "geometry" 解决了“遇到的无效字节序标志值”，但之后休眠将通过“模式验证：在表 [my_shema.my_geometry_table ]; 找到 [geometry (Types#OTHER)]，但期待 [bytea (Types#VARBINARY)]"

在添加 spring.jpa.properties.hibernate.dialect=org.hibernate.spatial.dialect.postgis.PostgisDialect 之后它终于起作用了。 ColumnDefinition 现在也是多余的

【讨论】：

【解决方案4】：

另请参阅，http://trac.osgeo.org/postgis/ticket/1830 在 Postgresql 9xx 和 Postgis 2xx 出现的时候出现了一个问题，在使用 postgres 实用程序 pgsql2shp 时导致了相同的“无效的字节序标志”错误。可以通过删除旧版本的库 libpq.so 来修复它，因为这是由于 Postgres 更改了 bytea 的默认行为。

【讨论】：

【解决方案5】：

在解决给定问题后，这里有一些步骤可以帮助我解决它。首先我应该提到我正在使用 WildFly 17 服务器、PostgreSQL 12 和 PostGIS 3.0.0。现在我认为对这个问题很重要的步骤：

在META-INF 中创建jboss-deployment-structure.xml 文件（如果你没有的话），并排除WildFly 自带的休眠

<jboss-deployment-structure>
    <deployment>
        <exclusions>
            <module name="org.hibernate" />
        </exclusions>
    </deployment>
</jboss-deployment-structure>

在你的 pom.xml 添加依赖项

<dependency>
    <groupId>org.hibernate</groupId>
        <artifactId>hibernate-core</artifactId>
    <version>5.4.12.Final</version>
</dependency>

和

<dependency>
    <groupId>org.hibernate</groupId>
        <artifactId>hibernate-spatial</artifactId>
    <version>5.4.12.Final</version>
</dependency>

确保休眠核心和休眠空间具有相同的版本（使用您喜欢的任何版本）。

你的persistence.xml 应该有财产

<property name="hibernate.dialect" value="org.hibernate.spatial.dialect.postgis.PostgisDialect"/>

最后，我认为这不是很重要，但我在 Java 中使用 org.locationtech.jts 表示几何。

我希望我没有跳过任何重要的步骤，并且这些是必需的步骤。可能还有其他东西，但是尝试不同的解决方案已经过去了很多小时，而且我可能忘记包含一些依赖项/属性。答案基于个人经验，因此请随时发表评论，证明我错了或扩大答案。无论如何，我希望有人会发现这个答案很有用。

【讨论】：

【解决方案6】：

我可以使用以下配置。我正在使用 Spring Boot 2.5.1、PostGIS 和 hibernate-spatial 5.4.32.Final。几个关键点：

我使用的 Point 类是 org.locationtech.jts.geom.Point
您不需要特殊注释。这是我的实体类。

实体：

@Enity public class Vehicle {

    @Id
    @GeneratedValue(strategy = GenerationType.IDENTITY)
    private Long id;

    private String name;    
    
    private Point location;
}

我也在application.properties中使用

spring.jpa.database-platform=org.hibernate.spatial.dialect.postgis.PostgisPG95Dialect

然后在服务类中，我可以通过如下调用将对象保存到数据库中。

public Vehicle createVehicle(String name, Double longitude, Double latitude) {
    GeometryFactory geometryFactory = new GeometryFactory(new PrecisionModel(), 4326);
        var point = geometryFactory.createPoint(new Coordinate(longitude, latitude));
    
        var vehicle = new Vehicle(name, point);      
        return vehicleRepository.save(vehicle);
}

【讨论】：