Windows 和 Ubuntu 中 mpiexec 的不同行为答案

【问题标题】：Different behavior of mpiexec in Windows and in UbuntuWindows 和 Ubuntu 中 mpiexec 的不同行为
【发布时间】：2019-06-25 19:33:50
【问题描述】：

我在 Fortran (program.f) 中有一个代码，我在 \ubuntu 16 和 Windows 7 中使用 Eclipse 编译了它。

Ubuntu 的 Eclipse 配置如下：

GNU Fortran Compiler: gfortran
Include paths(-l)   : /usr/lib/openmpi/include
GNU Fortran Linker  : mpif90
Tool Chain Editor   : GCC Fortran

Windows 的 Eclipse 配置如下：

GNU Fortran Compiler: gfortran
Include paths(-l)   : C:\cygwin64\usr\include
GNU Fortran Linker  : mpif90
Tool Chain Editor   : GCC Fortran

当我在 Ubuntu 中执行程序时，程序按预期运行。在 Ubuntu 中，该程序通过 2 个处理器执行

$ mpiexec -np 2 myprogram

而行为是跟随

$ mpiexec -np 2 myprogram 
 There are            2  processors running this job.
 Rank#           1 d1=           65  d2=          128
 Rank#           0 d1=            1  d2=           64

其中 d1 和 d2 是分配给每个处理器的问题域。在此示例中，总域为 128。域从 1 到 64 分配给处理器 0，从 65 到 128 分配给处理器 1。这是预期的行为：128 的模型分为 2，从 1 到 64 到处理器 0，处理器 1 从 65 到 128。

另一方面，在 Windows 中，使用上述规范编译代码后，我执行以下操作：

$ mpiexec.exe -n 2 myprogram.exe

并且行为是跟随

$ mpiexec -np 2 myprogram 
 There are            1  processors running this job.
 Rank#           0 d1=            1  d2=          128
 Rank#           0 d1=            1  d2=          128

我们可以看到行为有所不同：在 Windows 中执行的程序并没有像预期的那样并行运行。在终端中我们可以看到有 1 个处理器正在运行程序，域分配如下：从 1 到 128（整个域）到处理器 0，从 1 到 128（又是整个域？）到处理器 0。 这是我要解决的问题。我正在尝试拥有与 Ubuntu 中相同的行为。

适用于 Windows 的 mpiexec.exe 程序是从官方安装程序MS-MPI 获得的。

gfortran 和 Windows 的 OpenMPI 库是通过使用 cygwin 获得的

我尝试在 Eclipse for Windows 中更改 GNU 链接器和编译器，但不起作用。我尝试在其他装有 Windows 10 的机器上运行代码，问题是一样的。

关于如何尝试解决此问题的任何建议？

【问题讨论】：

请不要将 javascript sn-p 用于其他语言。使用{} 按钮或三个```
@VladimirF 你是对的，很快就会更正，谢谢
您的问题在编译 MPI 程序时很常见。您很可能正在使用 MPI 实现（在您的情况下，我认为它是 OpenMPI）在 Windows 上编译您的软件，并且您正在使用另一个 MPI 实现（很可能是 MS-MPI）来执行它。为了解决您在 Windows 上的问题，您应该对用于编译的 MPI 实现和用于运行并行程序的 MPI 实现保持一致。
@jcgiret 是的，没错，实现是OpenMPI，执行是通过MS-MPI。这是因为我没有找到在 Windows 中运行代码的 OpenMPI 实现。让我尽量保持一致并检查。谢谢！

标签： eclipse mpi gfortran

【解决方案1】：

正如@jcgiret 所说，存在一致性问题：程序使用 OpenMPI 编译，并使用 MS-MPI 执行。为了解决这个问题，代码使用与 openmpi 包中定义的 mpiexec 等效的代码执行：

usr/bin/mpiexec -> orterun.exe

程序在windows中执行

$ orterun.exe -n 2 myprogram.exe

那么结果和在Ubuntu下得到的结果是一样的：

$ orterun.exe -n 2 myprogram.exe 
There are            2  processors running this job.
Rank#           1 d1=           65  d2=          128
Rank#           0 d1=            1  d2=           64

【讨论】：