Python setuptools 不包括 C++ 标准库头文件

Question

我正在尝试将 Python 包装器编译为我编写的小型 C++ 库。我编写了以下setup.py 脚本来尝试使用setuptools 来编译包装器：

from setuptools import setup, Extension
import numpy as np
import os

atmcmodule = Extension(
    'atmc',
    include_dirs=[np.get_include(), '/usr/local/include'],
    libraries=['mcopt', 'c++'],  # my C++ library is at ./build/libmcopt.a
    library_dirs=[os.path.abspath('./build')],
    sources=['atmcmodule.cpp'],
    language='c++',
    extra_compile_args=['-std=c++11', '-v'],
    )

setup(name='tracking',
      version='0.1',
      description='Particle tracking and MC optimizer module',
      ext_modules=[atmcmodule],
      )

但是，当我在 OS X El Capitan 上运行 python setup.py build 时，clang 抱怨找不到一些 C++ 标准库头文件：

In file included from atmcmodule.cpp:7:
In file included from ./mcopt.h:11:
In file included from ./arma_include.h:4:
/usr/local/include/armadillo:54:12: fatal error: 'initializer_list' file not found
  #include <initializer_list>
           ^
1 error generated.
error: command 'gcc' failed with exit status 1

将-v 标志传递给编译器表明它正在搜索以下包含路径：

#include <...> search starts here:
 /Users/[username]/miniconda3/include
 /Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include
 /usr/local/include
 /Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include/c++/4.2.1/backward
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../lib/clang/7.0.0/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/usr/include
 /Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Platforms/MacOSX.platform/Developer/SDKs/MacOSX10.11.sdk/System/Library/Frameworks (framework directory)
End of search list.

这显然不包括 C++ 标准库头文件的路径。如果我使用-v 选项编译一个小型测试C++ 源代码，我可以看到clang++ 通常也会搜索路径/Applications/Xcode.app/Contents/Developer/Toolchains/XcodeDefault.xctoolchain/usr/bin/../include/c++/v1，如果我将此路径包含在include_dirs 选项中Extension 在我的@ 987654334@ 脚本，然后扩展模块正确编译并工作。但是，将此路径硬编码到脚本中似乎不是一个好的解决方案，因为此模块也需要在 Linux 上运行。

那么，我的问题是如何正确地使setuptools 包含所需的标头？

更新（2015 年 11 月 22 日）

当setuptools 尝试编译扩展时，它会打印它正在运行的第一个命令：

gcc -fno-strict-aliasing -DNDEBUG -g -fwrapv -O3 -Wall -Wstrict-prototypes -I/Users/[username]/miniconda3/include -arch x86_64 -I/Users/[username]/miniconda3/lib/python3.4/site-packages/numpy/core/include -I/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/mcopt -I/usr/local/include -I/Users/[username]/miniconda3/include/python3.4m -c /Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.cpp -o build/temp.macosx-10.5-x86_64-3.4/Users/[username]/Documents/Code/ar40-aug15/monte_carlo/atmc/atmcmodule.o -std=c++11 -fopenmp -v

如果我将此命令粘贴到终端并自己运行，则扩展编译成功。所以我怀疑setuptools 正在修改一些我不知道的环境变量，或者它对它实际运行的命令有点撒谎。

Answer 1

Setuptools 尝试使用 same flags used to compile the Python interpreter 编译 C/C++ 扩展模块。在 checking the flags 用于编译我的 Python 安装（来自 Anaconda）之后，我发现它正在编译的最低 Mac OS X 版本为 10.5。这似乎使它使用 GCC libstdc++ 而不是 clang 的 libc++ (which supports C++11)。

这可以通过将环境变量MACOSX_DEPLOYMENT_TARGET 设置为10.9（或更高版本）或将'-mmacosx-version-min=10.9' 添加到extra_compile_args 来解决。