相同gzip文件的Python md5哈希不一致

Question

我正在尝试使用 python 模块 gzip 压缩文件，然后使用 hashlib 对 gzip 文件进行哈希处理。我有以下代码：

import hashlib
import gzip

f_name = 'read_x.fastq'

for x in range(0,3):

    file = open(f_name, 'rb')

    myzip = gzip.open('test.gz', 'wb', compresslevel=1)

    n = 100000000
    try:
        print 'zipping ' + str(x)
        for chunk in iter(lambda: file.read(n), ''):
            myzip.write(chunk)
    finally:
        file.close()
        myzip.close()

    md5 = hashlib.md5()
    print 'hashing ' + str(x)
    with open('test.gz', 'r') as f:
        for chunk in iter(lambda: f.read(n), ''):
            md5.update(chunk)

    print md5.hexdigest()
    print '\n'

我认为应该简单地压缩文件，对其进行哈希处理并连续三次显示相同的输出哈希值。但是，我得到的输出是：

zipping 0
hashing 0
7bd80798bce074c65928e0cf9d66cae4


zipping 1
hashing 1
a3bd4e126e0a156c5d86df75baffc294


zipping 2
hashing 2
85812a39f388c388cb25a35c4fac87bf

如果我省略 gzip 步骤，并且连续 3 次对同一个 gzip 文件进行哈希处理，我确实会得到相同的输出 3 次：

hashing 0
ccfddd10c8fd1140db0b218124e7e9d3


hashing 1
ccfddd10c8fd1140db0b218124e7e9d3


hashing 2
ccfddd10c8fd1140db0b218124e7e9d3

谁能解释这里发生了什么？问题一定是gzip过程每次都不一样。但据我所知，DEFLATE 算法是 Huffman 编码后跟 LZ77（一种行程编码形式）或 LZ77 后跟 Huffman，因此给定相同的输入应该产生相同的输出。

Answer 1

压缩完全相同的内容会产生不同的 gzip 输出有几个原因：

• 压缩级别。这可以通过压缩级别参数进行控制。
• 标题中的原始文件的名称。如果您使用 gzip.GzipFile api 而不是 gzip.open api，您可以控制这一点。
• 修改时间也在标头中，也可以通过 gzip.GzipFile api 控制。

所以这里有一段代码演示了从 python gzip 获得可重现输出的正确和错误的方法：

import hashlib
import gzip

f_name = '/etc/passwd'
output_template = '/tmp/test{}.gz'

def digest(filename: str) -> str:
    md5 = hashlib.md5()
    with open(output_filename, 'rb') as f:
        for chunk in iter(lambda: f.read(block_size), b''):
            md5.update(chunk)
    return md5.hexdigest()

print("The default way - non identical outputs")
for x in range(0,3):
    input_handle = open(f_name, 'rb')
    output_filename = output_template.format(x)
    myzip = gzip.open(output_filename, 'wb')
    block_size = 4096
    try:
        for chunk in iter(lambda: input_handle.read(block_size), b''):
            myzip.write(chunk)
    finally:
        input_handle.close()
        myzip.close()
    print(digest(output_filename))

print("The right way to get identical outputs")
for x in range(3,6):
    input_handle = open(f_name, 'rb')
    output_filename = output_template.format(x)
    myzip = gzip.GzipFile(
        filename='',  # do not emit filename into the output gzip file
        mode='wb',
        fileobj=open(output_filename, 'wb'),
        mtime=0,
    )
    block_size = 4096
    try:
        for chunk in iter(lambda: input_handle.read(block_size), b''):
            myzip.write(chunk)
    finally:
        input_handle.close()
        myzip.close()
    print(digest(output_filename))

Answer 2

哦，但是等等……显然 gzip 将时间戳信息添加到 gzip 文件的标题中，因此哈希值会有所不同。