体积渲染 DICOMDIR CT 扫描答案

【问题标题】：Volume render DICOMDIR CT scan体积渲染 DICOMDIR CT 扫描
【发布时间】：2010-08-14 18:24:48
【问题描述】：

我从医院得到了一张 CD，它是头部 CD 扫描。

我对医学成像完全陌生。我想做 CT 扫描的体积渲染。

它是 DICOMDIR 格式。我将如何以及从哪里开始？

通过使用各种工具，我觉得我需要将每个系列提取为 DICOM 格式。这是正确的吗？如果是，我该怎么做？

【问题讨论】：

有一个针对医疗保健 IT 的 Stack Exchange 提案，这个问题最终可能更有意义。见这里：area51.stackexchange.com/proposals/6433/healthcare-it
相关：health.stackexchange.com/questions/1806/ct-scan-software

标签： dicom

【解决方案1】：

除非您获得体积数据，否则您的渲染充其量只会令人失望。许多机构仍然在单独的“步进切片”中获得头部 CT，而不是像体积一样，所以在这里你将拥有重要的“步进”神器。即使它是使用体积数据获取的，除非他们将所有数据传输到您的 CD 上，否则您仍然会被处理后的“平板”或“切片”图像卡住。进行体积渲染的最佳方法是实际拥有体积数据。 “切片图像”数据将大部分信息简化并删除。您只需在 256 x 256 x（8 或 16 位灰度）阵列数据中获得 20 或 30 张图像。

【讨论】：

我实际上是在一年后开始做的。我使用切片器从切片中构建一个卷。
【不小心按了回车键】我还用Meshlab把音量转成stl格式。从那里我得到了一个物理原型：s14.postimage.org/z1qexnswv/proto.jpg。 @NibbyX 使用切片时会丢失保真度，这是绝对正确的。然而，由于我有来自 3 个不同轴的切片，因此我可以在需要时提取更多细节。此外，如果我确实完成了另一次扫描，我应该要求什么才能获得体积数据？（假设实验室也愿意，并且可以放入 CD）。
我不支持这种数据纯度精英主义。容量数据是医务人员使用、想要和需要的。几乎没有大量数据不足的用例。

【解决方案2】：

如果您有 Mac，请尝试 OsiriX - 它是免费的、开源的，可以满足您的一切需求，甚至更多。如果您不这样做，而且这是一次性的，您可以随时注册免费演示商业级 DICOM 查看器。医学图像查看软件非常昂贵，没有演示就不可能出售。只需声称为临床医生工作，您就可以毫无问题地获得工作软件。

【讨论】：

是的，我在 vmware 的 mac 上使用过 OsiriX。这很棒。不幸的是，它只是一个查看器而不是一个渲染器。经过更多研究，我认为为了创建适当的 3d 渲染，您首先需要进行一些培训。
Osirix 可以产生一些非常漂亮的渲染。 osirix-viewer.com/OsiriX-GUI/VolumeRendering-02.jpg .. 我没有受过正规训练，但玩了几分钟后，我能够产生非常相似的图像。

【解决方案3】：

我相信ImageJ 会为您打开 DICOMDIR 中的任何文件。我不完全确定它是否可以从 DICOMDIR 打开整个研究，但我相当肯定它会处理您需要打开的任何单个文件。它还应该提供将图像导出为各种其他格式的选项。如果您需要更多信息，请随时发表评论。

【讨论】：

是的，我目前使用 imageJ。我尝试将它用于体积/表面渲染，但内存不足。我还意识到，不仅仅是以不同的格式导出文件并将它们输入到软件中以获得 3d 渲染，还需要做很多工作。

【解决方案4】：

您也可以尝试 MevisLab (http://www.mevislab.de/)，它是免费的，但使用起来有点复杂，并且可能需要两个步骤来渲染您的 dicom 图像。很可能您必须使用它们提供的其中一个小部件来转换图像，然后加载转换后的图像并进行渲染。

【讨论】：

【解决方案5】：

我已经完成了 ImageJ，但当时 ImageJ 不支持压缩 dicom 文件，您已经创建了自己的逻辑来读取压缩 dicom 文件。 Fiji 和 VolumeJ 也是体积渲染的好选择

【讨论】：

【解决方案6】：

试试Real3d VolViCon，这是一个用于重建计算机断层扫描 (CT)、磁共振 (MR)、超声和 X 射线图像的高级应用程序。它提供了将 3D 表面或体积导出为三角形网格文件的功能，以便使用 3D 打印技术创建物理模型。它还提供高质量的可视化、线性和角度测量工具以及各种类型的标记。它采用单个原始体积文件或一系列 2D（即 DICOM）文件并重建 3D 体积（体素）和网格（表面）模型。

【讨论】：