awk 数组输出行数和平均值答案

【问题标题】：awk array to output the line count as well as averageawk 数组输出行数和平均值
【发布时间】：2015-10-08 18:34:03
【问题描述】：

感谢@karakfa，下面的awk 数组导致了输出。我正在尝试将$2 添加到数组并输出它。 $2 基本上是唯一条目出现的次数。因为我正在学习 awk 数组，所以我不知道我的尝试是否接近。

输入：

chr1:955542-955763  AGRN:exon.1 1   0
chr1:955542-955763  AGRN:exon.1 2   0
chr1:985542-985763  AGRN:exon.2 1   0
chr1:985542-985763  AGRN:exon.2 2   1

我的脚本：

awk '{k=$1 OFS $2;
    l=$2;  # Is this correct?
    s[k]+=$4; c[k]++}
  END{for(i in s)  # Is this correct?
    print i, s[i]/c[i]},
      "(lbases)"  # Is this correct?' input

当前输出：

chr1:955542-955763 AGRN:exon.1 0
chr1:985542-985763 AGRN:exon.2 0.5

期望的输出：

chr1:955542-955763 AGRN:exon.1 0   (2 bases)
chr1:985542-985763 AGRN:exon.2 0.5 (2 bases)

【问题讨论】：

pluse-uno 用于输入、所需输出、当前输出和代码！！！继续发帖，祝你好运！
您了解原始 awk 脚本的工作原理/方式吗？因为没有那样做你想做的事情会变得更加困难。（具体来说，该尝试完全存储 l 的 one 值，并且未在输出中正确包含该变量。）
我编辑了您的脚本并在此过程中取出了一个明显的语法错误。您的脚本中仍有一些严重的错误，但现在，至少它可以运行了。
我理解awk（在我尝试之前）的方式是$1 存储为k，$2 中的唯一值定义了用于计算$4 平均值的行.我接近了吗？谢谢你:)。
awk 的一个弱点是缺乏调试支持（也许其他人会纠正我）。所以你需要学习使用像print "NR="NR "\tNF="NF"\tValueForVar_k="k "\tValForVar_l=" l 这样的语句进行调试。然后，您将很容易看到数据流入和流出脚本。（使用小文件进行测试！）。祝你好运。

标签： awk

【解决方案1】：

你尝试引入一个新变量是行不通的。您需要每个数组键的计数，因此变量应该是另一个数组。但在这种情况下，您不需要添加新数组，因为数组 c 已经包含每个键的计数。

awk '{k=$1 OFS $2;
    s[k]+=$4; c[k]++}
  END{for(i in s)
    print i, s[i]/c[i], c[i] " bases" }' input

还请注意，您的尝试如何不愉快地在 END 块的右大括号之外添加了“碱基”。

这与问题描述的不同之处在于key不是$2，而是$1和$2的组合。如果你真的需要唯一的密钥$2，你确实需要一个新数组，但是整个事情会变得相当复杂。

【讨论】：

非常感谢，效果很好 :) 并感谢您的解释 :)。