Impty grep 导致循环答案

【问题标题】：Impty grep result in loopImpty grep 导致循环
【发布时间】：2013-02-01 09:10:36
【问题描述】：

我对 shell 脚本非常陌生，所以这可能很容易回答

我在一个程序中发现了一些有趣的基因，输出是数据文件兴趣.txt

Nrg3
Srebf1
Cacna2d3
LOC100759725
LOC100761135
LOC100771217
LOC100769029

我有另一个数据文件 (unique_saml)，其中包含大部分这些名称以及其他信息例如

Nrg3    neuregulin_3    XM_003503005.1

所以我想编写一个脚本，它可以获取我的结果并从我的数据文件中 grep 其余数据

"#!/bin/sh
for ((  i = 0 ;  i <= 7; i++  ))
do  
cat interest.txt | head -$i | tail -1 | gawk '{print $1}' > tempname

name=`awk '{print $1 }' < tempname`

grep `echo $name` unique_saml >> results.txt
done

但是程序停止并且永远不会结束，因为在 unique_saml 文件中找不到 i = 4 = LOC100759725 = grep 返回空。

如何避免这种情况？

【问题讨论】：

标签： linux file unix grep

【解决方案1】：

grep 可以使用-f 从文件中读取模式：

$ grep -f interest.txt unique_saml
Nrg3    neuregulin_3    XM_003503005.1

如果您希望interest.txt 中的值仅匹配unique_saml 中的第一列：

$ sed 's/^/^/' interest.txt | grep -f - unique_saml
Nrg3    neuregulin_3    XM_003503005.1

【讨论】：

【解决方案2】：

如果您想遍历文件 interest.txt 并添加更多信息（如果可用），您可以执行以下操作：

cat interest.txt | while read line
do
   echo -e "$line\t`grep $line unique_saml | awk '{print $2 "\t" $3}'`"
done

【讨论】：