JCAMP-DX 数据格式是什么？答案

【问题标题】：What is the JCAMP-DX data format?JCAMP-DX 数据格式是什么？
【发布时间】：2014-11-13 02:41:25
【问题描述】：

我有一个输出 jcamp-dx (*.jdx) 文件的仪器。有一些软件可以用来查看数据，但我宁愿用它做一些其他的事情，比如在网页上绘制它，这在我必须访问数据的软件中是不允许的。

数据文件是纯文本，但它们有一些我尚未破译的奇怪格式。一个完整的数据文件here:

第一部分显然是一个标题，注意仪器设置。数据集摘录：

##DATA TABLE=       (X++(R..R)), XYDATA     $$ real data
0B11342B85545C23989C17351B74931B05470A26105D9294a1056e3313g0949f8969e3550c7777
0.003500000108b6949b6475c8140f4800i9368a29728a55860a65707a61314a41319a07814
0.006250000093f4324a7318C0833G6565A17668A50784A82638B02193B14577B15248A98749
0.008999999613A67352A16985D8866c0263a07145a73892b26727b51285b50303b20050a63440
...

有人可能会认为数据表会是某种 csv，不幸的是我没有看到这一点。下一个 like 不像其他行，所以假设它是一个校验和或一些编码字符串。其他 3 行（以及之后的其他行）似乎有一个模式，不幸的是我不知道如何将它们解码为有意义的数据。我敢肯定，只要有足够的时间，我就能弄清楚，但我希望更熟练的人可以向我指出结构。

0.008999999613, A67352, A16985, D8866, c0263, a07145, a73892, b26727, b51285, b50303, b20050, a63440,

我可以看到每个字母后面有 5 个数字。不知道这些字母是什么意思，它们似乎有所不同。也许大写 A 是正数，小写 a 是负数。 X++ 是什么计数器？

X，Y，我认为这是有道理的。然后 $$real 数据？强度怎么样？然后它下一个页面，数据表变为：

##DATA TABLE=       (X++(I..I)), XYDATA     $$ imaginary data

我可以看到数据表也有 197 个字符串。但我仍然只是猜测数据的实际含义及其格式。

有人可以在这里帮助我吗？这里有化学家吗？想法？让我感到困惑的是每组数字之间的字母变化。

是的，我看到了http://www.jcamp-dx.org/ 但我没有看到任何讨论数据格式的地方。

是否有任何开源工具可以将 jdx 转换为 csv？我只是在寻找一些东西来帮助我理解格式。请帮忙。

【问题讨论】：

标签： file csv format

【解决方案1】：

这是我发现的有关 JCAMP-DX 的信息。它是一个纯文本数据文件。我有一个 .jdx 文件，它是在红外波段测量的 CO2 吸收光谱。 .jdx 文件很容易在 Gnumeric 电子表格中打开。 .jdx 文件在编辑文件后在 Gnuplot 中很容易打开，将 # 放在任何没有初始 # 的注释行前面。

令我非常高兴的是，甚至没有阅读 cmets，CO2 吸收光谱文件就以我想要的 x 和 y 单位打开了。

Ubuntu Linux 上的 Gnuplot 4.6。 gnuplot>情节'co2.jdx';宾果游戏！

【讨论】：

【解决方案2】：

从该网站的“标准”导航链接链接的 PDF 中确实描述了该格式。

http://www.jcamp-dx.org/protocols.html

【讨论】：

jcamp-dx.org/protocols/…阅读
@j0h 你在这个问题上有什么进展吗？
@j0h 你可以从这个包的作者hyperspec.r-forge.r-project.org/index.html得到一些信息

【解决方案3】：

尽管这个问题是几年前发布的，但我只是偶然发现了它和一个可能的解决方案，尽管它需要专有软件。

事实证明，MATLAB（对我来说是 R2017a）有 built-in ability 来打开这些数据。

你可以跑

JCAMPStruct = jcampread(File)

其中 file 是指“指定文件名、路径和文件名或指向文件的 URL 的字符向量”。（我在此处引用链接中的帮助）。这对我来说非常有用，因为我可以通过分别访问 JCAMPStruct.Blocks.Xdata 和 ...Ydata 来提取 X（波数）和 Y（透射率）。

对于可以访问 MATLAB 的任何人（如果您在学术界工作，您的研究所可能已获得许可......），这应该是一个简单的解决方法。

【讨论】：