Matlab——读取大型netcdf文件答案

【问题标题】：Matlab-reading large netcdf filesMatlab——读取大型netcdf文件
【发布时间】：2016-08-18 16:24:09
【问题描述】：

我有一个 17G 的 netcdf 文件，我正尝试将其用于分析。 netcdf 文件中的每个变量都设置为：variable(x,y,z,time)。我想一次“一次”读入并分析变量，以便在 Matlab 中进行分析。换句话说，我想一次使用所有的 x、y 和 z 点。过去我有较小的文件，所以读取变量的设置如下：

fid=netcdf.open('filename/location','NC_NOWRITE');
var_id=netcdf.inqVarID(fid,'varname');
var=netcdf.getVar(fid,var_id);

是否可以在读入变量时使用一个时间步来读入变量？（语法不正确）它基本上看起来像

var=netcdf.getVar(fid,var_id,[:,:,:,time_index]);

【问题讨论】：

标签： matlab netcdf

【解决方案1】：

是的，matlab netcdf 命令支持这一点，几乎就像你写的那样：

data = netcdf.getVar(fid,var_id,var_index,var_length)

请参阅matlab documentation 了解更多信息。您也可以使用 high-level matlab commands 代替 netCDF 库函数。例如，如果varname 是一个 100x4 数组，您可以使用以下命令获取第 7 行：

% read 4 columns from 1 row of data starting at row 7, column 1
v = ncread('filename/location','varname',[7 1],[1 4]);

或者是一个四维数组，如题：

% read all data from dim. 1-3 at dim 4 = 27
v = ncread('filename/location','varname',[1 1 1 27],[Inf Inf Inf 1]);

【讨论】：

既然我有一个四维数组，我不需要启动像 data=netcdf.getVar(fid,var_id,[1 1 1 time_index] 这样的命令...我有很难找出计数和步幅应该是多少，以便从那时获取所有 x、y、z 数据。
我在答案中添加了一些示例代码。此外，matlab“高级”命令的文档比您正在使用的“包”命令的文档更好地解释了这个问题。请参阅答案中的新链接。