运行 maxnet 函数时出现索引错误（maxnet 包）答案

【问题标题】：Index error when running maxnet function (maxnet package)运行 maxnet 函数时出现索引错误（maxnet 包）
【发布时间】：2020-06-17 18:53:13
【问题描述】：

我使用 maxnet 函数（maxnet 包）作为集成模型中的模型算法之一。有时，代码执行时不会出错。其他时候，它会给我您在下面看到的错误消息。我正在使用 Windows 10 Pro（R 版本 3.6.1，Rstudio 版本 1.2.5042）。

代码：

dm.Maxent <- maxnet(p = train$species, data = train[-train$species],
                    maxnet.formula(p = train$species,
                         data = train[-train$species],
                         classes = "default"))

错误：

Error in intI(j, n = x@Dim[2], dn[[2]], give.dn = FALSE) : 
index larger than maximal 185

train 是一个数据框，有 621 行（每个出现/不存在点一行）和 29 列（28 列包含变量和 1 列“物种”，表示存在或不存在物种(0/1))。

【问题讨论】：

标签： r maxent

【解决方案1】：

我也有同样的问题。这是不可预测的，因为对于几个物种来说它运行良好，然后突然停止了。

我在这个链接上找到了回复：https://github.com/jamiemkass/ENMeval/issues/62

在新版本的 maxnet 中（查看 Github repo，因为看起来 CRAN 版本的 gas 还没有更新），有一个新的参数“addsamplestobackground”。当设置为 TRUE 时，它会解决其中的一些错误。目前，您必须使用 install_github 重新安装 maxnet 才能使用此参数。完成后， install_github 以获取 ENMeval (v2) 的 dev 分支版本，它将默认实现此功能。希望能解决这些问题。

我从 github 重新安装了 maxnet：

install.packages("remotes")
remotes::install_github("mrmaxent/maxnet")

并设置addsamplestobackground = T也许这会对你有所帮助。

【讨论】：