使用 Sweave 的 Makefile 依赖项

【问题标题】：Makefile dependencies with Sweave使用 Sweave 的 Makefile 依赖项
【发布时间】：2012-03-06 23:57:09
【问题描述】：

我正在尝试用一个 makefile 编译一个 Sweave 文档，使用存储在另一个目录中的数据，由当前目录中的脚本组装。工作流程是这样的：

datamaker.R > /otherdirectory/data > .rnw > .tex > .pdf

我目前有一个类似于下面创建的makefile：

MASTER = foo.pdf
VPATH = /otherdirectory
all: $(MASTER)
    open $<

data: datamaker.R
    R CMD BATCH 'datamaker.R'

foo.rnw: data

foo.tex: foo.rnw
    R CMD SWEAVE 'foo.rnw'

foo.pdf: foo.tex
    pdflatex foo.tex

问题在于 R CMD BATCH 命令每次都会运行，即使“datamaker”比“data”更早。我确定我遗漏了一些相当明显的东西，但我已经把头发拔了好几个小时了。

【问题讨论】：

猜测：R CMD BATCH 命令实际上在otherdirectory/ 中生成data，而不是在当前目录中，对吗？

标签： makefile sweave

【解决方案1】：

Make 正在尝试使用data 规则来构建data，这是foo.rnw 的先决条件，但data 规则实际上并没有构建data，它构建了otherdirectory/data。所以 Make 每次都会运行它，因为 data 永远不存在。

试试这个：

...

otherdirectory/data: datamaker.R
    R CMD BATCH 'datamaker.R'

foo.rnw: otherdirectory/data

...

【讨论】：

我认为这是添加 VPATH 变量的目的。无论如何，专门调用路径并不能解决问题。
您能否检查时间戳并确认 1) otherdirectory/data 存在，2) 它比 datamaker.R 更新，以及 3) otherdirectory/data 规则仍在执行中？我想确定一下，因为下一步非常复杂。
时间戳是有效的，但我找到了解决这个问题的另一种方法。但是，如果您想提供下一步，我很想听听。