如何将逗号分隔的数据加载到 R 中？答案

【问题标题】：How to load comma separated data into R?如何将逗号分隔的数据加载到 R 中？
【发布时间】：2011-09-17 00:20:20
【问题描述】：

我有一个这样的平面文件：

   x1,   x2,   x3,   x4,   x5
0.438,0.498,3.625,3.645,5.000
2.918,5.000,2.351,2.332,2.643
1.698,1.687,1.698,1.717,1.744
0.593,0.502,0.493,0.504,0.445
0.431,0.444,0.440,0.429,1.0
0.438,0.498,3.625,3.648,5.000

如何在 R 中加载它。

我已经尝试过这样做

> x <- read.table("C:\\flatFile.txt", header=TRUE)

但是在我做了一些操作之后，我得到了类似的错误

> colSums(x)
Error in colSums(x) : 'x' must be numeric

【问题讨论】：

?read.csv。我可以建议您花一些时间浏览一些通用的 R 介绍吗？我意识到cran.r-project.org/doc/manuals/R-intro.pdf 的覆盖面并不大，但是在cran.r-project.org/other-docs.html 有加载各种详细程度的文档，并为各种不同的受众设计（PS，也许我应该休息一下来自 StackOverflow 的一段时间——我似乎变得脾气暴躁）
对不起，我似乎没有找到正确读取数据的方法，逗号是问题......？
我同意 Ben Bolker 的观点，但我想补充一点，您应该使用 ?read.table 和 ?colSums （即查阅 R 帮助文件）。无论如何，请改用 read.csv()。
@Ben Bolker：你忘记了明显的R Data Import/Export。

标签： r load

【解决方案1】：

如果您查看read.table 上的帮助，您会发现一些本质上是read.table 具有不同默认值的额外功能。如果您倾向于阅读大量使用这些默认值最好阅读的文件，那么为了简洁起见，请使用它们而不是 read.table。

此代码将读入您的文件

x <- read.table("C:\\flatFile.txt", header=TRUE, sep = ',')

或此代码

x <- read.csv("C:\\flatFile.txt")

请注意，虽然您可以像read.table 一样设置这些基于read.table 的命令的任何功能，但使用它们并重申默认设置是毫无意义的。例如，如果您还要一直设置header = TRUE 和/或sep = ','，请不要打扰read.csv。在这种情况下，您不妨使用read.table。

【讨论】：

Read.table 是最好的，其中数据是无组织的，每列包含 2 到 3 个标签，中间用逗号分隔，但是，如果数据组织良好，那么 read.csv 是好的。

【解决方案2】：

您需要使用 colClasses 选项来读取.csv。像这样：

x <- read.csv("C:\\flatFile.txt", head=TRUE, colClasses=c("numeric","numeric","numeric","numeric"))

【讨论】：

???? header=TRUE（通过部分参数匹配来解释 head=TRUE 的方式）是 read.csv 的默认值，如果列包含所有数值，则将其解释为数字。我看不出您的建议与x <- read.csv("C:\\flatFile.txt") if 数据结构如上。 read.csv 是关键。
我在想 R 不知何故被输入数据弄糊涂了，需要被告知输入类型是什么。
我认为在这些情况下最好尝试准确了解问题所在。 R 看起来很神奇，因为它没有增加混乱...... :-)