在python中为csv文件中的列绘制直方图答案

【问题标题】：plotting a histogram for a column in a csv file in python在python中为csv文件中的列绘制直方图
【发布时间】：2015-01-07 17:35:03
【问题描述】：

我正在尝试为给定 csv 文件中的特定列绘制直方图和散点图。我是编程新手，我从朋友那里得到了这段代码，它显然有效，但不知何故我收到了这个错误。代码是：

import csv
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
f = open('Data for question 13.csv')
data = csv.reader(f)
Area = []; MajorAxisLength = []; MinorAxisLength = []; Perimeter = []
MinIntensity = []; MeanIntensity = []; MaxIntensity = []
header = [Area, MajorAxisLength, MinorAxisLength,Perimeter,MinIntensity,MeanIntensity,MaxIntensity]
for row in data:
    i = 1 
    for name in header:
        name.append(row[i])
        i = i + 1
plt.figure()
plt.hist(Area, bins=50) # error follows after this

错误：

Traceback (most recent call last):
  File "<pyshell#11>", line 1, in <module>
    plt.hist(Area, bins=50, alpha=0.5)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/pyplot.py", line 2827, in hist
    stacked=stacked, **kwargs)
  File "/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/matplotlib/axes.py", line 8312, in hist
    xmin = min(xmin, xi.min())
  File "/Library/Python/2.7/site-packages/numpy-1.9.0-py2.7-macosx-10.9-intel.egg/numpy/core/_methods.py", line 29, in _amin
    return umr_minimum(a, axis, None, out, keepdims)
TypeError: cannot perform reduce with flexible type

我无法摆脱这个错误。答案应该很简单，但由于我是新手，我不知道如何处理它。

【问题讨论】：

我无法重现这个。您的数据文件是什么样的？
有没有一种方法可以共享或上传数据文件以查看数据的外观？我不知道这是否会给您任何想法并有所帮助：它有 9 列带有标题和数字数据，直到大约 400 行。
要么将前几行粘贴到问题中（仅约 10 行），要么使用例如。 pastebin 并将链接放在问题中

标签： python csv matplotlib

【解决方案1】：

您收到错误是因为输入数据被 csv 解析器解释为字符串，而 hist 需要数字数据。您应该在附加之前显式转换每个 row[i]。

【讨论】：

【解决方案2】：

假设您只想在 csv 文件中绘制一些数字数据，并且数据是数字（不是文本），您可能可以使用此处提到的相同方法：How to read csv into record array in numpy?

因此，您的代码可能如下所示：

import csv
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

data = np.genfromtxt('Data for question 13.csv')  # add more parameter info if neccessary like skipping header lines
plt.figure()
plt.hist(data[:,0], bins=50)  # Area, from OP, is column 0

关于 genfromtxt 函数的信息可以在这里找到：http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/generated/numpy.genfromtxt.html

【讨论】：

嘿，我也试过这个，但我得到了太多索引的错误。 IndexError: 数组索引过多
那么听起来你的文件可能是空的。执行print(data.shape)（或Py2 中的print data.shape），如果是(0,0)，则您的文件有问题。您也可以在 Excel 中绘制它以了解您要查找的内容。您从我的错误和@hitzg 的答案中获得了足够的线索，您应该能够解决问题。 IndexError?数据不存在/足够大。 ValueError?看字符串；它是什么？可以兑换吗？

【解决方案3】：

我不能 100% 确定，因为我没有您的数据文件可用。但我认为row[i] 是一个字符串（而不是整数或浮点数）。您可以使用enumerate 跳过第一行。所以这应该可以解决问题：

for n,row in enumerate(data):
    if n > 0:
        i = 1 
        for name in header:
            name.append(float(row[i]))
            i = i + 1

【讨论】：

我试过了，但它仍然给我一个错误：ValueError: could not convert string to float: Area
如果文件的第一行包含标题，则必须跳过它。如果没有您正在使用的文件，很难为您提供帮助。而且我认为@James 的回答是更直接地做你想做的事。你应该阅读他链接的文档。
我在阅读文档后再次尝试跳过标题，它确实有效。感谢您的帮助。