python中两个数组的列的相关性答案

【问题标题】：Correlation of columns of two arrays in pythonpython中两个数组的列的相关性
【发布时间】：2022-01-12 21:34:34
【问题描述】：

我有两个数组：900x421 和 900x147。我需要关联这些数组中的所有列，以便输出为 421x147。在 Matlab 函数 corr() 中可以做到这一点，但我在 python 中找不到相同的函数。

【问题讨论】：

你看到了吗：numpy.corrcoef？
是的，但它给出了一个错误：all the input array dimensions for the concatenation axis must match exactly, but along dimension 1, the array at index 0 has size 421 and the array at index 1 has size 147
转置输入
它给出了同样的错误
如果两个输入都被转置，我会得到一个形状为568的数组，但我需要一个421x147的数组

【解决方案1】：

numpy.corrcoef 函数是要走的路。您需要两个参数 x 和 y 具有相同的形状。您可以通过连接两个数组来做到这一点。假设arr1 的形状为 900x421，arr2 的形状为 900x147。您可以执行以下操作

import numpy as np
two_arrays = np.concatenate((arr1, arr2), axis=1) # 900x568
corr = np.corrcoef(two_arrays.T) # 568x568 array
desired_output = corr[0:421, 421:]

np.corrcoef 将每一行视为一个变量，将每一列视为观察值。这就是我们需要转置数组的原因。

【讨论】：

非常感谢！但不幸的是，你的建议不起作用。结果 corr 是 900x900，desired_output 是一个形状为 900x0 的空数组。此外，由于我生成的数组将具有不同大小的硬编码，因此大小对我来说并不适用。我正在尝试提出一个在每列上都有循环的解决方案，但它似乎不是最理想的
你是对的。我编辑了我的代码来解决这个问题并对其进行了测试。对于不断变化的数组大小，您可以将数值替换为 arr1.shape[1] 之类的内容，例如获取 421 值。
但是为什么我应该选择前 421 个值而不是最后一个 421，或者从中间选择 421？这似乎很随意，但我需要一个数组中的 421 列与另一个数组的另外 147 个值相关
因为我将第二个数组arr2 连接到第一个数组arr1。 Numpy 按照您将数组传递给np.concatenate 的顺序添加数组。所以two_arrays的前421列对应arr1的列。
好的。非常感谢！