在 python 中绘制巨大散点图的问题。有一个更好的方法吗？答案

【问题标题】：Issues plotting huge scatter plot in python. Is there a better way to do this?在 python 中绘制巨大散点图的问题。有一个更好的方法吗？
【发布时间】：2021-04-24 11:19:18
【问题描述】：

我构建了一个巨大的 ndarray 对象，它是 2059263，2 维（一列用于 x 轴，另一列用于 y 轴）。我尝试使用不同颜色的点绘制散点图。我创建了另一个相同大小的数组列表，其中包含原始 ndarray 的信息。所以我尝试使用matplotlib.pyplot根据信息列表的类别结合ndarray轴信息来绘制散点图。我尝试使用 if 和 elif 条件循环，但循环是无限的...... 有没有另一种方法来处理一个巨大的轴阵列来绘制散点图......？还是我在编码时犯了错误？有没有更快的方法来做到这一点？可能问题是原点轴数组和每个点的信息是分开的......附上我的代码：

import re
import matplotlib.pyplot as plt

cdict = {0 : 'b', 1 : 'c', 2 : 'g', 3 : 'm', 4 : 'r', 5 : 'y',
         6 : 'brown', 7 : 'gold', 8 : 'lightseagreen', 9 : 'indigo', 10 : 'maroon',
         11 : 'cyan', 12 : 'olive', 13 : 'deeppink', 14 : 'sienna', 15 : 'crimson',
         16 : 'peru', 17 : 'lime', 18 : 'navy', 19 : 'orange'}

count = 1
for i in range(len(mapping)):
    if count != int(atr_list[i][1]):
        print("wrong sequence")
        print(count)
        print(atr_list[i])
        break
    else:
        attri = re.search('^\d{3}[0-9]', atr_list[i][0])

        if int(attri.group()) < 2001:
            colo = 0
        elif int(attri.group()) > 2000 and int(attri.group()) < 2006:
            colo = 1
        elif int(attri.group()) > 2005 and int(attri.group()) < 2011:
            colo = 2
        elif int(attri.group()) > 2010 and int(attri.group()) < 2016:
            colo = 3
        elif int(attri.group()) > 2015:
            colo = 4
        plt.scatter(mapping[i, 0], mapping[i, 1], c=cdict[colo])
        count += 1

plt.xlim(mapping[:, 0].min(), mapping[:, 0].max()) #
plt.ylim(mapping[:, 1].min(), mapping[:, 1].max()) #
plt.xlabel('t-SNE_x') #
plt.ylabel('t-SNE_y') #

plt.show() #

【问题讨论】：

看看seaborn hexbin。

标签： python matplotlib scatter-plot

【解决方案1】：

我发现那是我的编码错误。我应该不在循环中而是在循环之外编写 plt.scatter() 函数。由于我绘制了百万次散点图，它看起来像是一个无限循环。我很傻。

【讨论】：