Scanpy Matplotlib 斧头对象？答案

【问题标题】：Scanpy Matplotlib ax objects?Scanpy Matplotlib 斧头对象？
【发布时间】：2021-09-17 15:05:52
【问题描述】：

我正在使用 scanpy/python 分析一些单细胞 RNA-seq 数据。我想使用sc.pl.umap(show= False) 来制作斧头对象、编辑它们并相应地组合它们。我可以让一个 umap 工作，但我不能让多个 umap 在子图中组合在一起作为一个对象。有人可以帮我解决这个问题吗？

例如，我有两个数据集，我想将它们的 umap 组合到一个对象中，而不必事后在 powerpoint 中手动对齐它们。

谢谢

【问题讨论】：

请参阅How to ask a good question。始终提供带有代码、数据、错误、当前输出和预期输出的完整minimal reproducible example，如formatted text。如果相关，只有绘图图像是可以的。如果您不包含 mre，则该问题可能会被否决、关闭和删除。

【解决方案1】：

我建议你先自己创建 Figure 对象，然后将 'ax' 参数传递给 umap 函数。该文档指出“仅在绘制单个组件时才有效”

类似：

fig, axes = plt.subplots(1,2)
sc.pl.umap(show=False, ax=axes[0])

【讨论】：