如何使用散景显示对数刻度的直方图？

【问题标题】：How to show a histogram in log scale with bokeh?如何使用散景显示对数刻度的直方图？
【发布时间】：2017-02-13 16:25:26
【问题描述】：

问题都在标题中。我正在尝试使用从 bokeh.charts 导入的直方图对象，但无法弄清楚如何以对数比例显示它。在我的特殊情况下，我需要 x 轴和 y 轴都以对数刻度显示。

【问题讨论】：

【解决方案1】：

好吧，似乎可以有对数刻度。但是，我应该使用绘图 API，而不是使用图表 API：

import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show, output_notebook

output_notebook()

# generate random data from a powerlaw
measured = 1/np.random.power(2.5, 100000)

hist, edges = np.histogram(measured, bins=50)

p = figure(title="Power law (a=2.5)", x_axis_type="log", y_axis_type='log')
p.quad(top=hist, bottom=0, left=edges[:-1], right=edges[1:], line_color=None)

show(p)

感谢 bigreddot 对另一个问题的帮助！

【讨论】：

【解决方案2】：

请注意，@famagar 的上述解决方案不适用于最新版本的散景（刚刚尝试使用 0.12.14 -- 请参阅 this issue）。

问题在于日志缩放cannot properly handle zeros。

要解决这个问题，必须将bottom 参数设置为某个非零值。比如要得到和上图一样的结果bottom=1：

p.quad(top=hist, bottom=1, left=edges[:-1], right=edges[1:], line_color=None)

【讨论】：