【发布时间】:2016-11-02 09:28:25
【问题描述】:
对于 dask DataFrame ,什么相当于 pandas 中的 sort_values ?我正在尝试扩展一些存在内存问题的 Pandas 代码以使用 dask DataFrame。
相当于:
ddf.set_index([col1, col2], sorted=True)
?
【问题讨论】:
标签: python dataframe sorting dask
对于 dask DataFrame ,什么相当于 pandas 中的 sort_values ?我正在尝试扩展一些存在内存问题的 Pandas 代码以使用 dask DataFrame。
相当于:
ddf.set_index([col1, col2], sorted=True)
?
【问题讨论】:
标签: python dataframe sorting dask
我的首选方法是首先使用 dask 中的单个列 set_index,然后使用 map_partitions 分发 Pandas 的 sort_values
# Prepare data
import dask
import dask.dataframe as dd
data = dask.datasets.timeseries()
# Sort by 'name' and 'id'
data = data.set_index('name')
data = data.map_partitions(lambda df: df.sort_values(['name', 'id']))
一个可能的问题是单个索引值不能位于多个分区中。但从我在实践中看到的情况来看,Dask 似乎不允许这种情况发生。不过,对此有更有根据的意见会很好。
编辑:我在Dask dataframe: Can a single index be in multiple partitions? 中询问过这个问题
【讨论】:
并行排序很难。 Dask.dataframe 中有两个选项
现在,您可以使用 single 列索引调用 set_index:
In [1]: import pandas as pd
In [2]: import dask.dataframe as dd
In [3]: df = pd.DataFrame({'x': [3, 2, 1], 'y': ['a', 'b', 'c']})
In [4]: ddf = dd.from_pandas(df, npartitions=2)
In [5]: ddf.set_index('x').compute()
Out[5]:
y
x
1 c
2 b
3 a
Unfortunately dask.dataframe does not (as of November 2016) support multi-column indexes
In [6]: ddf.set_index(['x', 'y']).compute()
NotImplementedError: Dask dataframe does not yet support multi-indexes.
You tried to index with this index: ['x', 'y']
Indexes must be single columns only.
鉴于您如何表达您的问题,我怀疑这不适用于您,但通常使用排序的情况可以通过更便宜的解决方案 nlargest 解决。
In [7]: ddf.x.nlargest(2).compute()
Out[7]:
0 3
1 2
Name: x, dtype: int64
In [8]: ddf.nlargest(2, 'x').compute()
Out[8]:
x y
0 3 a
1 2 b
【讨论】:
nlargest 会正常工作吗?
您将使用此代码添加一个新的复合列并为其设置索引:
newcol = ddf.col1 + "|" + ddf.col2
ddf = ddf.assign(ind=newcol)
ddf = ddf.set_index('ind', sorted=True)
如果数据框已经按 (col1, col2) 排序,那么它也已经按 newcol 排序,因此您可以使用 sorted=True。
【讨论】:
sorted=True 表示您承诺 Dask 索引已已排序,而不是您请求 Dask 对其进行排序。见github.com/dask/dask/issues/2388