在matplotlib Python中将误差线的数据框绘制到数据框上答案

【问题标题】：Plotting a data frame of error bars onto a data frame in matplotlib Python在matplotlib Python中将误差线的数据框绘制到数据框上
【发布时间】：2020-10-13 00:03:24
【问题描述】：

我有一个值如下的熊猫数据框 (df)：

            0           1           2
0  100.000000  100.000000  100.000000
1    0.412497    0.668880  136.019498
2    5.144450   77.323610  163.496773
3   31.078457   78.151325  146.772621

我还有一个数据框 (deviation)，其中每个值都有错误：

          0         1         2
0  0.083579  0.048520  0.082328
1  0.005855  0.005904  0.046494
2  0.009907  0.080799  0.083671
3  0.045831  0.075932  0.044581

我已经成功地按照我的意愿使用 matplotlib 绘制 df：

但是，我正在努力将误差线放到此图表上。我的绘图代码目前如下：

drugCount = 3
df = pd.DataFrame(drug)
deviation = pd.DataFrame(deviation)
df.columns = list(string.ascii_uppercase[0:drugCount])
ax = df.T.plot(kind='bar', yerr=deviation, color=['C0', 'C3', 'C1', 'C2'])

plt.xlabel('Drug')
plt.ylabel('% Cell viability')
plt.legend(labels=['Control', 'High', 'Medium', 'Low'])
plt.title('Viability of HeLa cells against various drugs')

plt.show()

如您所见，我正在尝试将 deviation 数据帧传递给 yerr 标志，但它没有执行任何操作，并且出现错误：

/usr/local/lib/python3.8/site-packages/numpy/core/_asarray.py:83: UserWarning: Warning: converting a masked element to nan.
  return array(a, dtype, copy=False, order=order)

我在网上看过，但似乎没有多少人像我一样尝试添加这么多错误栏。我需要进行哪些更改才能使其正常工作？

【问题讨论】：

既然不能指定单独的数据框，不如如下组合起来。df = pd.concat([df.T, deviation.T],axis=1)
@r-beginners 不错的建议，但我将如何在梳理后绘制数据？
我尝试将它们结合起来，但还有一个根本性的问题。它的误差线太低而没有意义。此外，yerr=[val,val,val] 无法设置多个错误栏，所以我放弃了回答。

标签： python pandas dataframe matplotlib

【解决方案1】：

尝试将偏差列在列表中（乘以 100 以查看任何内容）

ax = df.T.plot(kind='bar', yerr=list(deviation.values*100) color=['C0', 'C3', 'C1', 'C2'])

【讨论】：