awk 或有条件的不工作

Question

输入：制表符分隔的输入文件，有 15 列，其中第 15 列是整数。

输出：满足条件的行数。

我的代码：

$ closest-features --closest --no-overlaps --delim '\t' --dist --ec megatrans_enhancers.sorted.bed ../../data/alu_repeats.sorted.bed | awk -v OFS='\t' '{if ($15 <= 1000 || $15 >= -1000) print $0}' | wc -l
1188

||在这种情况下，条件语句无法正常工作（文件中的总行数为 1188 行，并且我确定至少有些行不满足条件），因为如果我删除 OR 条件语句，那么它突然就可以工作了：

$ closest-features --closest --no-overlaps --delim '\t' --dist --ec megatrans_enhancers.sorted.bed ../../data/alu_repeats.sorted.bed | awk -v OFS='\t' '{if ($15 <= 1000) print $0}' | wc -l
926

不知道我做错了什么。有什么建议吗？

Awk 命令输入示例：

chr1    378268  378486  chr1-798_Enhancer       17.2    +       chr1    375923  376219  AluY|SINE|Alu-HOMER529  0       +       E:375923        0.044   -2050
chr1    1079471 1079689 chr1-929_Enhancer       14.6    -       chr1    1071271 1071563 AluSx1|SINE|Alu-HOMER1669       0       -       E:1071271       0.13    -7909
chr1    1080259 1080477 chr1-830_Enhancer       16.7    -       chr1    1071271 1071563 AluSx1|SINE|Alu-HOMER1669       0       -       E:1071271       0.13    -8697
chr1    6611744 6611962 chr1-241_Enhancer       46.6    +       chr1    6611431 6611723 AluSc|SINE|Alu-HOMER10257       0       +       E:6611431       0.089   -22
chr1    6959639 6959857 chr1-58_Enhancer        100.1   -       chr1    6966612 6966911 AluSx|SINE|Alu-HOMER11041       0       -       E:6966612       0.137   6756
chr1    6960593 6960811 chr1-202_Enhancer       51.6    -       chr1    6966612 6966911 AluSx|SINE|Alu-HOMER11041       0       -       E:6966612       0.137   5802
chr1    7447888 7448106 chr1-2_Enhancer 181.9   -       chr1    7449489 7449799 AluSz|SINE|Alu-HOMER11879       0       +       E:7449489       0.119   1384
chr1    10752461        10752679        chr1-131_Enhancer       65.4    -       chr1    10752754        10753065        AluSq2|SINE|Alu-HOMER19455      0       +       E:10752754      0.106      76
chr1    12485694        12485912        chr1-353_Enhancer       36.7    +       chr1    12487328        12487634        AluSx3|SINE|Alu-HOMER23581      0       +       E:12487328      0.085      1417
chr1    12486469        12486687        chr1-141_Enhancer       63.6    +       chr1    12487328        12487634        AluSx3|SINE|Alu-HOMER23581      0       +       E:12487328      0.085      642

Answer 1

尝试设置&& 条件，因为数字应大于-1000 且小于1000。

Your_command | awk '$15<=1000 && $15>=-1000{count++} END{print count}'

在上面的awk 中添加-F"\t"，以防您的输入也以TAB 分隔。在awk 之后也不需要使用wc -l。我已经为此编写了逻辑，因此通过创建一个名为 count 的变量并在 Input_file 的最后打印它来给出满足条件的行数。

此外，对于您提供的示例输出，3 我认为这是正确的。