Python IOError：[Errno 5] 输入/输出错误？答案

【问题标题】：Python IOError: [Errno 5] Input/output error?Python IOError：[Errno 5] 输入/输出错误？
【发布时间】：2018-09-17 23:31:34
【问题描述】：

我正在远程服务器上运行一个使用 nohup 的 python 脚本。

首先我使用 VPN 和 SSH 连接到远程机器
其次，我使用以下命令运行 python 脚本：

nohup python backmap.py mpirun -np 48 &

python 脚本包含以下几行：

frame = []
file_in = open("Traj_equil_prot.pdb", "r")
for line in file_in:
    if line.startswith('TITLE'):
        frame.append(line[127:134])

import os
for fileNum in range(631, 29969):
    os.system("./initram-v5.sh -f Traj_equil_prot_frame" +  str(fileNum) + ".pdb -o Traj_equilprot_aa_frame" + str(frame[fileNum]) + ".gro -to amber -p topol.top")

脚本一整天都运行良好。但现在它刚刚崩溃，当我再次尝试重新启动它时，我收到以下错误：

Traceback（最近一次调用最后一次）：文件“”，第 1 行，in IOError: [Errno 5] 输入/输出错误

该文件位于工作目录中。我试图再次断开/连接，但仍然是同样的问题。我不知道我错过了什么。请帮忙？

【问题讨论】：

我不确定是否相关，但您从未关闭过file_in
我只是尝试在 python 中打开文件并使用 file_in.close() 关闭它。断开并重新连接到远程计算机并再次运行脚本，但我仍然收到相同的错误：/

标签： python

【解决方案1】：

我有同样的问题，我曾经使用这个命令运行我的脚本：

python MY_SCRIPT.py &

脚本将在后台运行，输出将显示在终端上，直到您注销或退出。

通过注销，脚本仍在运行，但它的输出无处显示，因此，当脚本要显示某些内容时（例如调用 print）会出现异常。

解决方案：

我已将输出通过管道传送到实际终端显示之外的其他地方：

python MY_SCRIPT.py >/dev/null &

【讨论】：

或者我认为你可以使用 nohup。 nohup python myscript.py &

【解决方案2】：

我终于通过打开文件“file_in”、修改它（例如，只需在 REMARK 行中添加一个点）并保存更改来解决问题。

【讨论】：