将多个工具作为单个 bash 脚本运行

Question

我正在孤立地做不同的程序。假设一个命令行参数用于 C++ 工具，另一个用于 R。但起初我为 C++ 应用程序运行命令行参数，这会给我一个结果文件。只有这样我才能为 R 应用程序运行另一个命令行，该命令行需要来自 C++ 应用程序的结果文件。

我可能有许多不同的数据需要处理。有什么方法可以制作一个 bash 脚本以允许循环不同的工具（C++、R、任何其他工具）？所以我就坐下来，不用手动写很多命令行参数？

我想睡觉，而一个耗时的循环正在我的计算机中发出噪音。

Answer 1

以某种定义的顺序运行多个不同的程序是 bash 等（系统）脚本语言的基本思想：

## run those three programms in sequence
first argument
second parameter
third
# same as
first argument; second parameter; third

你可以做很多花哨的事情，比如重定向输入和输出流：

grep secret secrets.file | grep -V strong | sort > result.file
# pipe | feeds everything from the standard output
# of the programm on the left into
# the standard input of the one on the right

这还包括条件语句，当然还有循环：

while IFS= read -r -d '' file; do
  preprocess "$file"
  some_work | generate "$file.output"
done < <(find ./data -type f -name 'source*' -print0)

如您所见，bash 本身就是一种编程语言，恕我直言，它的语法有点奇怪。