【发布时间】:2021-01-22 10:30:41
【问题描述】:
我有一堆被命名的文件
190307_M05898_0065_000000000-CC66F_1_11570BP0321L01_1.fastq.gz
190307_M05898_0065_000000000-CC66F_1_11570BP0321L01_2.fastq.gz
190307_M05898_0065_000000000-CC66F_1_11570BP0322L01_1.fastq.gz
190307_M05898_0065_000000000-CC66F_1_11570BP0322L01_2.fastq.gz
等等……
它们都与_1和_2配对,标志着差异。我用粗体突出了每对之间的区别。我制作了一个 .csv,其中一列包含 bold ID 和要替换整个字符串的新 ID。
使用命令行我怎么说“从第 1 列中查找此特定字符串并用第 2 列中的新 ID 替换”但还要保留特定字符串之后的所有内容(即 _1.fastq.gz 或 _2.fastq.gz )
我想结束:
BK1_1.fastq.gz
BK1_2.fastq.gz
BN46_1.fastq.gz
BN46_2.fastq.gz
编辑:
如果有帮助,我还创建了一个包含完整文件名的 csv,而不仅仅是 ID
【问题讨论】:
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你用的是什么外壳?列也是逗号分隔的吗?
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重击?我认为?是的,它保存为 csv
标签: macos command-line terminal