从制表符分隔的文本文件中删除字符串中包含特定数字的行答案

【问题标题】：Deleting rows from a tab delimited text file that contain a certain number in a string从制表符分隔的文本文件中删除字符串中包含特定数字的行
【发布时间】：2015-12-01 20:35:33
【问题描述】：

所以我有这样的数据

chr1    169845117   169845232   -   ENSG00000000457.9_exNb11
chr1    169847773   169847960   -   ENSG00000000457.9_exNb12
chr1    169771760   169771866   +   ENSG00000000460.12_exNb4
chr1    169772308   169772450   +   ENSG00000000460.12_exNb5
chr6    41046766    41046903    +   ENSG00000001167.10_exNb2
chr6    41051783    41051931    +   ENSG00000001167.10_exNb4
chr6    41057316    41057449    +   ENSG00000001167.10_exNb5
chr6    41057941    41058048    +   ENSG00000001167.10_exNb6
chr6    41059265    41059433    +   ENSG00000001167.10_exNb7
chr6    41060649    41060824    +   ENSG00000001167.10_exNb8
chr6    41062133    41062236    +   ENSG00000001167.10_exNb9
chr6    46097728    46097926    +   ENSG00000001561.6_exNb1

我想删除第 5 列中 exNb 字符串末尾有 1 的行，例如上面的最后一行。可能有一个 awk 或 sed 选项可以让我这样做，但由于我对这两种语言的经验为零，我希望有人能帮助我，我不确定这有多复杂。

编辑：想要的结果如下

chr1    169845117   169845232   -   ENSG00000000457.9_exNb11
chr1    169847773   169847960   -   ENSG00000000457.9_exNb12
chr1    169771760   169771866   +   ENSG00000000460.12_exNb4
chr1    169772308   169772450   +   ENSG00000000460.12_exNb5
chr6    41046766    41046903    +   ENSG00000001167.10_exNb2
chr6    41051783    41051931    +   ENSG00000001167.10_exNb4
chr6    41057316    41057449    +   ENSG00000001167.10_exNb5
chr6    41057941    41058048    +   ENSG00000001167.10_exNb6
chr6    41059265    41059433    +   ENSG00000001167.10_exNb7
chr6    41060649    41060824    +   ENSG00000001167.10_exNb8
chr6    41062133    41062236    +   ENSG00000001167.10_exNb9

【问题讨论】：

已为您编辑。本质上唯一改变的是最后一行被删除，因为它有一个 1。如果你有生物学背景，我只是想从我的分析中删除所有第一个外显子。
您只需要grep -v 'exNb1$' filename 即可排除这些行

标签： awk sed

【解决方案1】：

awk -F\\t '$5 ~ /1$/ {next} {print}'

如果可能有尾随空格，那么您可能希望通过使用/1 *$/ 作为正则表达式来加强上述内容。如果您的文件真的像您描述的那样简单，那么您可以使用grep -v '1$'（或grep -v '1 *$'）等。

当然，如果标准是基于所有尾随数字的数值，那么您必须进行调整。（在这种情况下，您必须考虑“01”、“1E0”、“1.0”、“0.1e1”等）

【讨论】：

这个好像解决了，非常感谢！只要我被允许，我会接受这个作为答案。
或者只是awk '!/1$/'。请注意，tab 是默认分隔符之一。此外，我们可以简单地匹配整行，因为我们正在检查最后一列。
这不会也删除以exNb11、exNb21 等结尾的行吗？
哦，是的，我明白了。但是您的 awk 解决方案也在这样做。（我只是看了你的答案，而不是问题）。那么应该是grep -v '[^[:digit:]]1$'