如何根据列匹配从两个输入文件生成输出？ [关闭]答案

【问题标题】：How do I generate an output from two input files based on column matches? [closed]如何根据列匹配从两个输入文件生成输出？ [关闭]
【发布时间】：2012-12-06 12:11:15
【问题描述】：

输入1

1 886817 2 122 C:0.983607 T:0.0163934

1 886817 3 123 C:2.111 CATTTT:1.11

输入 2

1 886817 rs10465241 C T 100 PASS AC=1573;

1 886817。 C CATTTT 874 PASS AVGPOST=0.9884;

输出

1 886817 rs10465241 C T 100 PASS AC=1573;REF=0.983607;ALT=0.0163934

1 886817 。 CATTTT 874 PASS AVGPOST=0.9884;REF=2.111;ALT=1.11

输出是根据加粗的列匹配生成的。REF 和 ALT 值正在添加

【问题讨论】：

你为什么一遍又一遍地问同样的问题？

标签： shell sed awk

【解决方案1】：

我想我刚刚回答了this 的问题。然而，一些小的变化：

awk 'FNR==NR { split($5,a,":"); split($6,b,":"); c[$1,$2,a[1],b[1]]="REF=" a[2] ";ALT=" b[2]; next } ($1,$2,$4,$5) in c { print $0 c[$1,$2,$4,$5] }' file1 file2

结果：

1 886817 rs10465241 C T 100 PASS AC=1573;REF=0.983607;ALT=0.0163934
1 886817 . C CATTTT 874 PASS AVGPOST=0.9884;REF=2.111;ALT=1.11

【讨论】：