匹配来自两个不同数据集（dbSNP ID）的 col 值并合并数据集答案

【问题标题】：Match col values from two different datasets (dbSNP ID's) and merge dataset匹配来自两个不同数据集（dbSNP ID）的 col 值并合并数据集
【发布时间】：2019-03-05 11:39:26
【问题描述】：

我有两个数据集 A 和 B。我希望将数据集 A 中的 dbSNP ID 与 B 进行匹配。如果匹配，那么对于该 SNPid，想要获取该行的其他 col 值并与数据集 A 中存在的 cols 合并。

注意：生物信息学中的新内容，在 Linux 脚本或 R 中探索。

【问题讨论】：

欢迎来到 SO。请参考这个网站问正确的问题：how-to-ask
当然。我是新来的。请允许回答这个问题。我会处理帖子标准
使用 R，How to join (merge) data frames (inner, outer, left, right)? 可能重复
使用 shell/awk/join，Linux Combine two files by column 可能重复

标签： r shell bioinformatics

【解决方案1】：

使用merge

merge(A, B, by = 'dbSNP_ID')

这会在“by”指定的列中查找两个数据集共有的条目并组合行信息。输出是一个数据集，其中只有两个数据集共有的条目以及匹配行的所有其他 col 值。

【讨论】：