按行名连接多个表[重复]答案

【问题标题】：Join multiple tables by row names [duplicate]按行名连接多个表[重复]
【发布时间】：2018-03-22 10:04:40
【问题描述】：

我想按行名合并多个表。这些表的行数不同，并且它们具有唯一和共享的行，它们都应该出现在输出中。如果可能的话，我想用awk 解决这个问题，但我也可以用其他解决方案。

table1.tab

a 5
b 5
d 9

table2.tab

a 1
b 2
c 8
e 11

我想得到下表的输出：

table3.tab

我尝试使用join

join table1.tab table2.tab > table3.tab

但我明白了

table3.tab

a 5 1
b 5 2

行c、d 和e 不在输出中。

【问题讨论】：

标签： bash shell join awk

【解决方案1】：

你想做一个完整的外连接：

join -a1 -a2 -o 0 1.2 2.2 -e "0" table1.tab table2.tab

a 5 1
b 5 2
c 0 8
d 9 0
e 0 11

【讨论】：

【解决方案2】：

这个 awk oneliner 应该适用于您的示例：

awk 'NR==FNR{a[$1]=$2;k[$1];next}{b[$1]=$2;k[$1]}
END{for(x in k)printf"%s %d %d\n",x,a[x],b[x]}' table1 table2

测试

kent$  head f1 f2
==> f1 <==
a 5
b 5
d 9

==> f2 <==
a 1
b 2
c 8
e 11

kent$  awk 'NR==FNR{a[$1]=$2;k[$1];next}{b[$1]=$2;k[$1]}END{for(x in k)printf"%s %d %d\n",x,a[x],b[x]}'  f1 f2
a 5 1
b 5 2
c 0 8
d 9 0
e 0 11

【讨论】：

非常感谢您的回答！可以很好地解决给定的问题！ awk 仍然适用于以这种方式合并超过 2 个表吗？修改单行以添加从 n 个（例如 20 个）表派生的附加列的最佳方法是什么？
@user2715173 gawk 有 ARGIND 变量，它对处理多输入文件很有用，尤其是 >3 的情况。我建议使用“数组数组”来处理 n 个表的情况。你可以在这里找到一些细节：gnu.org/software/gawk/manual/html_node/Arrays-of-Arrays.html