如何在 Jupyter Notebook 中运行 shell 脚本？答案

【问题标题】：How to run a shell script in Jupyter Notebook?如何在 Jupyter Notebook 中运行 shell 脚本？
【发布时间】：2019-11-21 18:38:02
【问题描述】：

所以我有这个 shell 脚本，它运行一个我将在 Jupyter 中使用的程序，但它是面向 bash 的，我尝试使用 subprocess 模块，我得到了error: OSError: [Errno 13] Permission denied。但是，该脚本与 ipynb 文件位于我的目录中，因此我应该具有权限。

import subprocess
subprocess.call(['./Heasoft.sh'])

这就是我所拥有的一切；它适用于终端，但不适用于笔记本。是不是我做错了什么？

【问题讨论】：

试试subprocess.call('./Heasoft.sh', shell=True)
我做到了，它跑了！但是我得到了一个数字的输出，这正常吗？
最好将脚本的预期输出放入并放入一些代码来重现错误。那么任何人都很容易帮助你。你的脚本文件也有足够的权限吗？做chmod u+x Heasoft.sh

标签： python bash shell jupyter-notebook

【解决方案1】：

chmod +x Heasoft.sh 应该解决这个问题。如果没有，请在 shell 脚本顶部添加 #!/bin/bash。

【讨论】：

【解决方案2】：

您还可以通过键入 jupyter 笔记本单元格来简单地运行任何脚本：

%%sh
cat myscript.sh 
./myscript.sh

【讨论】：