R中的命名空间循环引用

Question

帮助，我被 R 折磨着。当我尝试加载一个名为 RedTor 的自定义包时。它生成

错误：loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()) 中“RedTor”的包或命名空间加载失败， 版本检查 = vI[[i]]): namespace ‘rlang’ 0.4.7 已经加载，但 >= 0.4.9 是必需的

我检查了显而易见的。我安装了 0.4.10 版的 rlang。这不仅仅与 RedTor 有关。 library(dplyr) 生成相同的错误。它更加普遍，似乎是一个命名空间问题。如果我使用 unloadNamespace() 函数

unloadNamespace("rlang")

我明白了

unloadNamespace("rlang") 中的错误： 命名空间‘rlang’由‘ellipsis’、‘testthat’、‘pkgload’、‘pillar’、‘lifecycle’、‘htmltools’、>‘usethis’导入，所以无法卸载

所以我需要卸载那些，但这些可能会反过来生成其他消息。

这似乎与在 R 中加载的内容有关。我运行 sessionInfo() 并注意通过命名空间（而不是附加）加载的内容 - 大约 30-41 个包。希望我知道如何防止这些加载。任何帮助表示赞赏。据我所知，我没有加载 .rdata，也没有加载 .renviron 中的包。

下面是我启动 R 时 sessionInfo() 的结果。它显示 rlang 的 0.4.7 版本正在加载，即使我安装了 0.4.10。我很确定这不仅仅是 rlang，而且 rlang 只是第一个抛出错误的人。这是因为正在通过“过时”的命名空间加载其他包。

R 版本 3.6.3 (2020-02-29) 平台：x86_64-w64-mingw32/x64（64位） 运行于：Windows 10 x64（内部版本 18363）

矩阵产品：默认

语言环境： [1] LC_COLLATE=English_United States.1252 LC_CTYPE=English_United States.1252
LC_MONETARY=English_United States.1252 [4] LC_NUMERIC=C LC_TIME=English_United States.1252

附加的基础包： [1] stats graphics grDevices utils datasets methods base

其他附加包： [1] devtools_2.2.1 使用this_1.6.1

通过命名空间加载（未附加）： [1] prettyunits_1.1.1 ps_1.3.0 fansi_0.4.0 rprojroot_1.3-2 withr_2.2.0
摘要_0.6.23蜡笔_1.3.4
[8] assertthat_0.2.1 R6_2.4.1 backports_1.1.5 magrittr_1.5 rlang_0.4.7
cli_2.0.2 遥控器_2.1.1
[15] rstudioapi_0.11 fs_1.4.1 testthat_2.3.2 callr_3.4.3 ellipsis_0.3.0
desc_1.2.0 工具_3.6.3
[22] 胶水_1.4.2 编译器_3.6.3 pkgload_1.0.2 进程x_3.4.1 pkgbuild_1.0.8
sessioninfo_1.1.1 memoise_1.1.0

最后，我什至尝试运行一个脚本来卸载所有命名空间

si <- sessionInfo()
loadednames <- names(si$loadedOnly)
ctr <- 1
n <- length(loadednames)
nold <- n + 1
while (n > 0 & n < nold) {
  cat(n, " ")
  for (i in n:1) {
    try(unloadNamespace(loadednames[i]), silent = TRUE)
  }
  si <- sessionInfo()
  loadednames <- names(si$loadedOnly)
  n <- length(loadednames)  
  ctr <- ctr + 1
  if ( ctr > 100) break
}

这不会卸载所有命名空间。但它让我降到了大约 20。这是运行上述内容后 sessionInfo() 的部分输出。 rlang 仍在列表中：

通过命名空间加载（未附加）：
[1] pkgload_1.0.2 R6_2.4.1 rlang_0.4.7 fansi_0.4.0 tools_3.6.3
pkgbuild_1.0.8 sessioninfo_1.1.1 [8] cli_2.0.2 with r_2.2.0 ellipsis_0.3.0 remotes_2.1.1 assertthat_0.2.1
摘要_0.6.23蜡笔_1.3.4
[15] processx_3.4.1 callr_3.4.3 fs_1.4.1 memoise_1.1.0 glue_1.4.2
compiler_3.6.3 prettyunits_1.1.1

所以现在我只是尝试卸载剩余的命名空间，直到我最终可以加载我的 RedTor 包。这是一个曲折的过程，我们将不胜感激。

Answer 1

我认为问题在于我的 .rprofile 中的 require(devtools) 语句。删除似乎已经清除了它。