手动更改 ggplot 的颜色

Question

我正在尝试手动更改 ggplot 中的颜色，以便将我的箱线图颜色编码为组（例如 Qilai 和 Nagigi 相同的颜色）。我运行了以下代码，它工作得很好。

B1 <- ggplot(tissue_A, aes(x=Site, y=d15N.permil)) + geom_boxplot() + 
  geom_signif(comparisons = list(c("Suva", "Nagigi")), y_position = 14.3, map_signif_level=TRUE) +  
  geom_signif(comparisons=list(c("Suva", "Qilai")),
  y_position = 13.8, tip_length = 0.03, vjust=0.2, map_signif_level=TRUE)

然后我尝试稍后重新运行它，除了颜色之外一切正常。我更改了代码以使用以下代码将事物分开：

B1 + labs(title = "T. jarbua Tissue", y = "δ15 permil") + scale_fill_manual(values = c("yellow","yellow", "red","red"), name = "Site")

ggplot(tissue_A, aes(x=Site, y=d15N.permil)) + geom_boxplot() + 
  geom_signif(comparisons = list(c("Suva", "Nagigi")), y_position = 14.3, map_signif_level=TRUE) +  geom_signif(comparisons=list(c("Suva", "Qilai")), y_position = 13.8, tip_length = 0.03, vjust=0.2, map_signif_level=TRUE) + scale_fill_manual(values = c("yellow","yellow", "red","red"), name = "Site")

除了颜色有效外，我仍然拥有一切。我的 R 工作室是最新的，我已经尝试重新启动。有什么可能会阻止我的代码运行吗？

谢谢！

Answer 1

我相信您在调用aes 时缺少fill 参数。参见this tutorial:的以下示例

library(ggplot2)

ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose)
bp<-ggplot(ToothGrowth, aes(x=dose, y=len, fill=dose)) +
  geom_boxplot()
bp

生成以下图，按剂量着色。

调用aes时应加fill=Site。